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毕业论文设计
辩论小组:第一小组
辩论人:王生瑞
专业:生物技术
海绵共附生放线菌的别离分类及初步鉴定
论文框架
海绵共附生放线菌的别离分类及初步鉴定
1.1海洋放线菌及其产生的活性物质
1.2海绵及其共生微生物产生的次级代谢产物
1.3本论文研究的目的及意义
2.3海绵共生放线菌的别离方法
2.4放线菌的分类鉴定方法
3.1海绵共生放线菌的别离结果
3.2菌株的分类鉴定结果
2.3海绵共生放线菌的别离方法
1
2
3
海绵样品的采集与处理
别离培养基的选择
放线菌的别离
2.4放线菌的分类鉴定方法
形态学特征和培养特征鉴定
16SrDNA序列分析及其系统发育分析
3结果分析
1对于同一样品,在不同培养基上获得的放线菌数量和种类差异较大,在含有抑制剂的SC淀粉酪素琼脂培养基上别离的放线菌数量多。从菌落表观特征、生长速度、基丝与气丝的形态色泽和孢子特征来看,在SC淀粉酪素琼脂培养基上别离到的放线菌种类也最多。
2实验中从海绵样品中,共别离获得12株放线菌菌株:HNM0046、HNM0047、HNM0048、HNM0050、HNM0051、HNM0055、HNM0060、HNM0061、HNM0064、HNM0071、HNM0080、HNM0083。
高氏一号培养基
SC淀粉酪素培养基
HV培养基
M2培养基
Raffinose-histidinemedium
别离到的放线菌种类
3.2菌株的分类鉴定
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海绵共附生放线菌12株别离菌株在酵母膏麦芽膏培养基〔ISP2〕中生长良好,形成丰富的气生菌丝和基生菌丝,基内菌丝和气生菌丝高度分支,基内菌丝淡黄色,不断裂,孢子丝颜色早期灰色,培养后期变为黑褐色,孢子链呈螺旋状,外表不光滑,有褶皱。放线菌呈分枝丝状,分支较多交错在一起,由基内菌丝、气生菌丝和孢子丝三局部组成,基内菌丝为透明,有较多的分枝;气生菌丝较暗。两种菌丝在不同的焦平面上,可以调节细准焦螺旋分别进行观察。由菌落特征,放线菌的细胞有基内菌丝和气生菌丝的分化,气生菌丝到成熟时又会分化成孢子丝并产生成串的干粉状孢子,这些气生菌丝或孢子丝伸展在空气中,菌丝间一般都不存在毛细管水。这就使放线菌获得其特有的与细菌不同的菌落特征:枯燥、不透明,外表呈紧密的丝绒状,菌落和培养基的连接紧密,难以挑取菌落。这种形态特征特别符合链霉菌属中典型菌株的形态特征。因此,推测这12株菌株可能属于链霉菌属中的成员。
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3.2菌株的分类鉴定
以提取的基因组DNA为模板,以27F、1492R为引物,进行PCR扩增,获得菌株HNM0046、HNM0047、HNM0048、HNM0050、HNM0051、HNM0060、HNM0061、HNM0064、HNM0071、HNM0080、HNM0083电泳结果〔见图7、图8〕。经测序获得菌株HNM0046的16SrDNA近全长序列为1423bp;菌株HNM0047的16SrDNA近全长序列为1420bp;菌株HNM0048的16SrDNA近全长序列为1433bp;菌株HNM0050的16SrDNA近全长序列为1431bp;菌株HNM0051的16SrDNA近全长序列为1431bp;菌株HNM0060的16SrDNA近全长序列为1428bp;菌株HNM0061的16SrDNA近全长序列为1447bp;菌株HNM0064的16SrDNA近全长序列为1428bp;菌株HNM0071的16SrDNA近全长序列为1438bp;菌株HNM0080的16SrDNA近全长序列为1436bp;菌株HNM0083的16SrDNA近全长序列为1426bp。
测得已别离出的这12株菌株的16SrRNA基因序列有效片段长度都在1400bp以上,在Eztaxoon数据库中进行有效种的序列相似性有哪些信誉好的足球投注网站,发现与链霉菌属的菌株高度相关,将每株菌与最相似的标准菌株、以及相似性等做表。
基于16SrDNA序列以及系统发育树分析说明,所有菌株都与Streptomycewuyuanensis在系统发育树上聚在同一个分支上,且序列相似性都在97%以上,最高到达98.57%,而StreptomycewuyuanensisFX61〔T〕/〔JX010725〕是由北京理工大学的张鑫等在2013年1月别离获得,并通过DNA-DNA杂交初步确定为一
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