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关于污染的产生及防治第1页,共25页,星期日,2025年,2月5日PCR实验室污染的特点概念:由于各种原因,造成的PCR扩增体系中出现了非目的检测样本本身的模板,使得PCR结果出现假阳性。PCR实验室的污染不同于一般生物安全实验室的污染PCR污染总是产生假阳性结果第2页,共25页,星期日,2025年,2月5日PCR流程样品准备(samplepreparation)反应体系配置(PCRreactionassembly)PCR反应(PCRexecution)反应后分析(post-PCRanalysis)第3页,共25页,星期日,2025年,2月5日PCR污染的途径操作错误或者误差造成的样品间交差污染PCR试剂的污染PCR实验器材的污染气溶胶(AmpliconAerosol)第4页,共25页,星期日,2025年,2月5日PCR污染的四种来源标本或模板间的交叉污染PCR试剂的污染PCR扩增产物的污染实验室克隆质粒的污染第5页,共25页,星期日,2025年,2月5日引起PCR污染的原因标本或模板间交叉污染容器被污染标本或模板放置时,由于密封不严溢于容器外容器外粘有模板而造成相互间交叉污染标本核酸模板在提取过程中,由于吸样枪污染导致标本间污染模板吸取过程中,因气溶胶(aerosol)或其他原因引起移液器污染,从而导致交叉污染有些微生物标本尤其是病毒可随气溶胶或形成气溶胶而扩散,导致彼此间的污染第6页,共25页,星期日,2025年,2月5日引起PCR污染的原因PCR试剂污染PCR试剂配制过程中,移液器、容器、水及其他溶液等原因造成试剂被PCR核酸模板污染。第7页,共25页,星期日,2025年,2月5日引起PCR污染的原因PCR产物污染-最主要最常见PCR产物拷贝量大(一般为10^13拷贝/ml),远远高于PCR检测数个拷贝的极限。极微量的PCR产物污染,就可形成假阳性。移液器吸取PCR产物进行电泳检测,同一支移液器去准备PCRmixPCR产物的气溶胶污染:据计算一个气溶胶颗粒可含48000拷贝,因而由其造成的污染是一个值得特别重视的问题.气溶胶(aerosol):悬浮于气体介质中粒径一般为0.001μm~1000μm的固体、液体微小粒子形成的胶溶状态散体系。
空气与液体面摩擦时就可形成气溶胶,在操作时比较剧烈地摇动反应管,开盖时、吸样时及移液器的反复吸样都可形成气溶胶第8页,共25页,星期日,2025年,2月5日引起PCR污染的原因实验室中克隆质粒的污染在分子生物学实验室及某些用克隆质粒做阳性对照的检验室,这个问题也比较常见克隆质粒在单位容积内含量浓度高,另外在纯化过程中需用较多的用具及试剂,而且在活细胞内的质粒,由于活细胞的生长繁殖的简便性及具有很强的生命力.其污染可能性也很大第9页,共25页,星期日,2025年,2月5日PCR污染的监测一个好的实验室,要时刻注意污染的监测,考虑有无污染,是什么原因造成的污染,以便采取措施,防止和消除污染.PCR强大扩增能力+检测的敏感性经30个周期后,特定DNA片段的数量在理论上可增加109倍极微量的污染便可导致假阳性,尤其对定量造成很大的问题NTC(NoTemplateControl):必须设置一个不含模板DNA但含有PCR系统中所有其他成分的对照反应。第10页,共25页,星期日,2025年,2月5日对照试验1.阳性对照:它是PCR反应是否成功、产物条带位置及大小是否合乎理论要求的一个重要的参考标志。但阳性对照尤其是重组质粒及高浓度阳性标本,其对检测或扩增样品污染的可能性很大,操作时需注意防止交叉污染。2.阴性对照:每次PCR实验务必做阴性对照,它包括①阴性标本对照(NTC):被检的标本是血清,就用鉴定后的正常血清作对照;被检的标本是组织细胞就用相应的组织细胞作对照。②试剂空白对照(Blank):在PCR试剂中不加模板DNA或RNA,进行PCR扩增,以监测试剂是否污染。3.重复性试验4.选择不同区域的引物进行PCR扩增第11页,共25页,星期日,2025年,2月5日污染的预防进行PCR操作时,操作人员应该严格遵守一些操作规程,最大程度地降低可能出现的PCR污染或杜绝污染的出现。主要涉及:(1)划分操作区(2)分装试剂(3)实验操作注意事项第12页,共25页,星期日,2025年,2月5日划分操作区--理想的PCR实验室分
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