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生物序列的同源性有哪些信誉好的足球投注网站简介及其应用.ppt

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*结果页面(一)图形示意结果第23页,共73页,星期日,2025年,2月5日*结果页面(二)目标序列描述部分带有genbank的链接,点击可以进入相应的genbank序列匹配情况,分值,e值第24页,共73页,星期日,2025年,2月5日*结果页面(三)详细的比对上的序列的排列情况第25页,共73页,星期日,2025年,2月5日*一个具体的例子(blastp)假设以下为一未知蛋白序列query_seqMSDNGPQSNQRSAPRITFGGPTDSTDNNQNGGRNGARPKQRRPQGLPNNTASWFTALTQHGKEELRFPRGQGVPINTNSGPDDQIGYYRRATRRVRGGDGKMKELSPRWYFYYLGTGPEASLPYGANKEGIVWVATEGALNTPKDHIGTRNPNNNAATVLQLPQGTTLPKGFYAEGSRGGSQASSRSSSRSRGNSRNSTPGSSRGNSPARMASGGGETALALLLLDRLNQLESKVSGKGQQQQGQTVTKKSAAEASKKPRQKRTATKQYNVTQAFGRRGPEQTQGNFGDQDLIRQGTDYKHWPQIAQFAPSASAFFGMSRIGMEVTPSGTWLTYHGAIKLDDKDPQFKDNVILLNKHIDAYKTFPPTEPKKDKKKKTDEAQPLPQRQKKQPTVTLLPAADMDDFSRQLQNSMSGASADSTQA我们通过blast有哪些信誉好的足球投注网站来获取一些这个序列的信息。第26页,共73页,星期日,2025年,2月5日*具体步骤1.登陆blast主页/BLAST/2.根据数据类型,选择合适的程序3.填写表单信息4.提交任务5.查看和分析结果第27页,共73页,星期日,2025年,2月5日*分析过程(一)1.登陆ncbi的blast主页2.选择程序,因为查询序列是蛋白序列可以选择blastp,点击进入也可以选择tblastn作为演示,我们这里选blastp第28页,共73页,星期日,2025年,2月5日*分析过程(二)3.填入序列(copy+paste)Fasta格式,或者纯序列4.选择有哪些信誉好的足球投注网站区域,这里我们要有哪些信誉好的足球投注网站整个序列,不填5.选择有哪些信誉好的足球投注网站数据库,这里我们选nr(非冗余的蛋白序列库)。是否有哪些信誉好的足球投注网站保守区域数据库(cdd),蛋白序列有哪些信誉好的足球投注网站才有。我们选上第29页,共73页,星期日,2025年,2月5日*分析过程(三)6.限制条件,我们限制在病毒里面找。7.其他选项保持默认值打分矩阵第30页,共73页,星期日,2025年,2月5日*分析过程(四)8.输出格式选项保持默认值9.点击开始有哪些信誉好的足球投注网站第31页,共73页,星期日,2025年,2月5日*分析过程(五)10.查询序列的一些相关信息在cdd库里面找到两个保守区域,点击可以进入第32页,共73页,星期日,2025年,2月5日*分析过程(六)图形结果第33页,共73页,星期日,2025年,2月5日*分析过程(七)匹配序列列表第34页,共73页,星期日,2025年,2月5日*分析过程(八)具体匹配情况第35页,共73页,星期日,2025年,2月5日*为什么使用单机版的Blast? 1.特殊的数据库要求。 2.涉及序列的隐私与价值。 3.批量处理 4.其他原因??单机版的Blast使用(一)第36页,共73页,星期日,2025年,2月5日*单机版Blast的基本操作过程 1.下载单机版的Blast程序/blast/executables/目录下,下载对应的操作系统版本。 2.解压程序包(blast-2.28-ia32-linux.tar.gz)命令是:$tarzxvfblast-2.28-ia32-linux.tar.gz 单机版的Blast使用(二)第37页,共73页,星期日,2025年,2月5日*下载正确的Blast程序包blast:在本地运行的blast程序包wwwblast:在本地服务器建立blast服务的网站netblast:blast的客户端程序,直接链接至NCBI的BLAST服务器,使用BLAST服务,不需浏览器。第38页,共73页,星期日,2025年,2月5日*下载正确的Blast程序包Blast程序包的名字上还包括了该程序包运行的硬件和操作系统环境:硬件环境(CPU)操作系统sparcpowerPCia32ia64amd64mipsalphalinuxmacoxsolarisirixaixfreebsdwin32hpu

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