昆明裂腹鱼的谱系地理学研究.pdf

目录

摘要V

ABSTRACTVIII

1引言1

1.1青藏高原地质历史和环境变化1

1.2裂腹鱼类概述2

1.3昆明裂腹鱼及其研究现状4

1.3.1昆明裂腹鱼的简介4

1.3.2昆明裂腹鱼研究现状5

1.4谱系地理学概述5

1.5形态学表型特征比较的研究方法7

1.5.1传统形态度量法7

1.5.2几何形态学8

1.6分子标记及其在生物遗传演化中的应用10

1.6.1线粒体基因标记介绍及其应用11

1.6.2核基因及其应用12

1.7本研究目的与意义14

2昆明裂腹鱼的形态特征研究15

2.1前言15

2.2材料与方法15

2.2.1样品采集15

2.2.2测量方法17

2.2.3数据分析20

2.3结果与分析22

2.3.1传统形态学分析结果22

2.3.2几何形态学分析结果24

2.4讨论31

2.5小结32

3基于线粒体基因的昆明裂腹鱼遗传多样性和种群结构分析34

3.1前言34

3.2材料与方法34

3.2.1标本采集34

3.2.2实验材料35

3.2.3实验方法36

3.2.4数据分析39

3.3结果与分析41

3.3.1序列信息41

3.3.2基于线粒体DNA的昆明裂腹鱼遗传多样性分析42

3.3.3系统发育分析及单倍型网络图44

3.3.4昆明裂腹鱼种群遗传结构48

3.3.5昆明裂腹鱼种群历史动态50

3.4讨论52

3.4.1昆明裂腹鱼的遗传多样性52

3.4.2昆明裂腹鱼的系统发育和遗传分化52

3.4.3种群动态历史53

3.5小结54

4基于核基因的昆明裂腹鱼遗传多样性和种群结构分析55

4.1前言55

4.2材料与方法55

4.2.1标本采集55

4.2.2总DNA的提取和检测55

4.2.3PCR扩增及测序56

4.2.4数据分析57

4.3结果与分析57

4.3.1序列信息57

4.3.2基于核基因的昆明裂腹鱼遗传多样性分析58

4.3.3系统发育分析与核基因网络图59

4.3.4昆明裂腹鱼种群遗传结构62

4.3.5昆明裂腹鱼种群历史动态64

4.4讨论66

4.4.1种群遗传多样性和遗传分化66

4.4.2种群动态历史67

4.4.3线粒体基因和核基因分子标记的比较68

4.5小结68

5结论和展望70

参考文献72

附录86

致谢91

攻读硕士学位期间主要研究成果94

贵州师范大学学位论文原创性声明95

贵州师范大学学位论文使用授权书95

摘要

昆明裂腹鱼（Schizothoraxgrahami）隶属于鲤形目（Cypriniformes）、

鲤科（Cyprinidae）、裂腹鱼亚科（Schizothoracnae）、裂腹鱼属

（Schizothorax），是分布于我国西南地区的重要冷水性鱼类，是长江

上游特有种。本文采集了覆盖金沙江、赤水河