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蓖麻bZIP基因家族的全基因组鉴定、生物信息学及表达分析
目录
蓖麻bZIP基因家族的全基因组鉴定、生物信息学及表达分析（1）．．4
内容简述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.2文献综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
1.3研究目标与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
2.1实验材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
2.1.1植物样本．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
2.1.2测序仪器与试剂．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10
2.2实验方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
2.2.1基因组DNA提取．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
2.2.2基因组测序技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13
2.2.3生物信息学分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14
2.2.4表达分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
蓖麻bZIP基因家族的全基因组鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
3.1蓖麻基因组概况．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
3.2蓖麻bZIP基因家族结构分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19
3.3蓖麻bZIP基因家族的全基因组鉴定结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20
bZIP基因家族的功能注释与分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
4.1功能注释方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23
4.2家族成员的分类与注释．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
4.3家族成员的功能预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25
生物信息学分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27
5.1家族成员的进化树构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28
5.2家族成员的同源性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29
5.3家族成员的互作网络分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30
5.4家族成员的转录调控网络分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33
6.1家族成员在不同组织的表达模式分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33
6.2家族成员在不同发育阶段表达模式分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34
6.3家族成员在环境胁迫下的表达响应分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36
蓖麻bZIP基因家族的全基因组鉴定、生物信息学及表达分析（2）．37
内容概要．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
1.2研究目的．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38
1.3研究方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38
蓖麻bZIP基因家族的全基因组鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40
2.1数据来源．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41
2.2鉴定方法．．．．．．．．．．．
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