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#数据库#GeneCards数据库介绍
Peaker
GeneCards数据库是由以色列曼科学的关于
及其产物以及生物医学应用的文献库。GeneCards以卡片的形式给出结
果,其中列出所查询的:
蛋白质的同源性及其在疾病中的作用等;
2、相关;
3、相关疾病列表;
4、有关的研究;
5、医学应用,如根据该的有关知识而建立的新的治疗与诊断方
法等。
与GeneCards的有HUGO(HumanGeneNomenclature
Committee)、GDB(GenomeDatabase)、MGD(MouseGenome
Database)等。可通过、符号、接受号等进行查询。
GeneCards数据库中收录了非常全面的相关信息,包括同义
名,相关药物,功能,相关疾病,相关miRNA
等。今天我们就介绍一下如何通过GeneCards数据库获取信息。
GeneCards:
上图为GeneCards主页,主页下面为检索栏,可通过多种模式
进行检索,例如,symbol,同义名等等。我们以
TP53为例。
匹配得分,从大到小排序,通过观察,我们发现红框内第一个检索到的
TP53为我们要检索的。
接下里我们点击TP53前面的加号,可以看到详细信息
点击TP53跳转到详细信息,如图
第一部分可以看到相关同义名和基本描述。如下图描述信息
可以看到来自不同数据源的对TP53的描述信息。
如图,我们可以从GeneCards里查询到的序列信息,表观遗传信
息,等。
上图是关于分子功能的介绍,主要是从Goterm的角度进行功能
注释。每个功能注释后面附有evidence验证信息,以及文献验证的结
果。
除了Go以外,还可以检索到相关的pathway功能注释。另外Ge
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