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基于高通量测序的青花菜KASP标记开发与应用
目录
基于高通量测序的青花菜KASP标记开发与应用（1）．．．．．．．．．．．．．．4
内容概要．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.1研究背景及意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.2研究目的和任务．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
高通量测序技术概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
2.1高通量测序技术原理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
2.2高通量测序技术流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
2.3高通量测序技术应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
青花菜基因组学研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
3.1青花菜基因组特点．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
3.2青花菜基因组测序进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13
3.3青花菜基因组数据库建立．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
KASP标记开发．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
4.1KASP标记原理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
4.2KASP标记开发流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
4.3KASP标记在青花菜中的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20
基于高通量测序的青花菜KASP标记开发．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21
5.1序列数据来源与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
5.2序列比对与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23
5.3KASP标记候选区域筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25
5.4KASP标记验证与性能评估．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26
青花菜KASP标记的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28
6.1品种鉴定与纯度检测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29
6.2遗传多样性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30
6.3遗传图谱构建与QTL定位．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30
6.4分子辅助育种．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
结果与讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
7.1KASP标记开发结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33
7.2KASP标记应用结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34
7.3结果讨论与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35
展望与结论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36
8.1研究展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
8.2研究结论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38
基于高通量测序的青花菜KASP标记开发与应用（2）．．．．．．．．．．．．．39
内容综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39
1.1研究背景及意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40
1.2研究目的和任务．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41
高通量测序技术概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．
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