转录组学、代谢组学联合揭示百合花杜鹃花瓣颜色差异性.pdf

目录

摘要IV

AbstractVI

第一章文献综述1

1.1百合花杜鹃的概述1

1.2植物花色研究进展1

1.3类黄酮研究概述2

1.4类黄酮合成途径中主要酶和基因3

1.5代谢组学研究概述及研究进展3

1.5.1代谢组学概述3

1.5.2代谢组学研究进展4

1.6转录组学研究概述及研究进展5

1.6.1转录组学概述5

1.6.2转录组学研究进展6

1.7多组学联合分析的应用6

1.8研究目的与意义7

1.9技术路线8

第二章转录组学揭示百合花杜鹃花色差异性9

2.1实验材料9

2.2转录组测序、组装和注释9

2.2.1RNA9

总提取、文库构建和测序

2.2.2序列过滤、拼接和组装9

2.2.3单基因功能注释和表达水平分析9

2.2.4DEGs筛选及富集分析10

2.2.5转录组测序与组装10

2.3功能注释结果12

2.3.1GO注释及分类13

2.3.2KOG注释及分类14

2.4合花杜鹃花瓣黄白部位DEGs的筛选及DEGs的富集分析15

2.4.1DEGs的筛选15

2.4.2差异表达基因（DEGs）GO富集16

2.4.3差异基因（DEGs）的KEGG富集分析17

2.5讨论及结论21

2.5.1讨论21

2.5.2结论22

第三章UPLC-MS/MS分析揭示百合花杜鹃花色差异性23

3.1研究方法23

3.1.1样品提取23

3.1.2超高液相色谱采集23

3.1.3质谱23

3.1.4代谢物定性及定量分析分析24

3.1.5数据质控与统计分析24

3.1.6百合花杜鹃形态特征及代谢物总体特征25

3.2结果27

3.2.1百合花杜鹃花瓣黄白两个部分的代谢物种类鉴定与比较..27

3.2.2百合花杜鹃花瓣黄白两个部分的主要差异代谢物对比28

3.2.3基于KEGG的代谢物分析30

3.3讨论及结论32

3.3.1讨论32

3.3.2结论33

第四章转录组学、代谢组学相关性分析35

4.1代谢物与基因相关性网络35

4.2讨论及结论38

4.2.1讨论38

4.2.2结论41

第五章总结与展望42

5.1总结42

5.2展望43

参考文献45

附录60

致谢65

攻读硕士研究生期间主要研究成果67

贵州师范大学学位论文原创性声明68

贵州师范大学学位论文使用授权书68

贵州师范大学硕士学位论文

摘要

在观赏性植物中，花瓣的颜色是植物重要的特征。然而百合花杜

鹃花瓣黄白两个部分的颜色产生差异的原因仍不清楚。为了揭示百合

花杜鹃花瓣颜色的差异性，本研究利用转录组测序和高效液相色谱串

联质谱（UPLC-MS/MS）对百合花杜鹃花瓣黄白两部分进行了研究。

DEGsW

转录组差异表达基因（）分析表明，（白色部分）与（黄

色部分）Y相比，2310个unigene上调，3062个下调。DEGs中有36

个参与了类黄酮生物合成途径。通路富集分析表明，DEGs显著富集

在苯丙素合成途径、类黄酮合成途径以及异黄酮合成途径；这表明

CHS、F3’5’H、FLS、I2’H、HID、DFR、LAR这些酶基因可能

是引起百合花杜鹃花色差异性的关键性因素。

UPLC-MS/MS

百合花杜鹃花瓣高效液相色谱串联质谱（