噬菌体疗法概论ICTV发布的噬菌体分类和命名讲解.pptx

职业教育医学生物技术专业教学资源库ICTV发布的噬菌体分类和命名噬菌体疗法概论

ICTV发布的噬菌体分类和命名一、ICTV发布的噬菌体分类和命名噬菌体的系统分类传统上基于噬菌体内部的核酸类型及电镜观察到的形状，对噬菌体在科水平上进行分类。该方法始于20世纪60年代DavidBradly开始使用电镜图像和吖啶橙(acridineorange)荧光染色，将有尾噬菌体分为A(肌尾)、B(长非收缩尾)、C(短非收缩尾)3组，即后来ICTV采用的肌尾病毒科(也称肌尾噬菌体科，Myoviridae)、长尾病毒科(也称长尾噬菌体科，Siphoviridae)和短尾病毒科(也称短尾噬菌体科，Podoviridae)。

ICTV发布的噬菌体分类和命名一、ICTV发布的噬菌体分类和命名1998年，Ackermann建议设立有尾病毒目(也称有尾噬菌体目)(Caudovirales)将所有的有尾噬菌体包括在内，并被ICTV所采纳。以后随着蛋白质组和基因组等技术发展，噬菌体的分类增加了自复制病毒科(Autographivirinae)等科，并在ICTV2018bMasterSpecies#34V(2019年5月31日更新发布)中增加了埃克曼病毒科(Ackermanviridae)和黑列尔病毒科(Herelleviridae)2个新科。

ICTV发布的噬菌体分类和命名一、ICTV发布的噬菌体分类和命名噬菌体分类与命名在2015~2018年经过了较大幅度的调整：(1)噬菌体从原来的1个目和10个科，变为1个目12个科，其中新增的埃克曼病毒科由原来肌尾病毒科Vilvirus属中的噬菌体(14种：DickeyavirusLimestone,大肠埃希菌病毒EscherichiavirusCBA120、EscherichiavirusECML4、EscherichiavirusPhaxl;沙门菌病毒SalmonellavirusDet7、SalmonellavirusMarshall、SalmonellavirusMaynard,SalmonellavirusSFP10、SalmonellavirusSH19、SalmonellavirusSJ2、SalmonellavirusSJ3、SalmonellavirusSTML131、SalmonellavirusVil,以及志贺杆菌病毒ShigellavirusAG3)调整组成，并分为2个亚科和3个属，还有3个未确定种。新增的黑列尔病毒科由原来肌尾病毒科Spounavirinae亚科中与芽孢杆菌噬菌体SPO1类似的噬菌体组成，分为5个亚科、15个属，还有7个未确定种。

ICTV发布的噬菌体分类和命名一、ICTV发布的噬菌体分类和命名(2)RNA噬菌体的2个科囊状病毒科(Cystoviridae)和光滑病毒科(Leviviridae)因使用RNA依赖的RNA聚合酶，而划在新增顶级阶元的Riboviria圈下。(3)从最后变动的类别和日期来看，在ICVT发布的病毒分类表中，几乎所有的噬菌体都在2015~2018年这4年间进行了位置移动(moved)、重命名(renamed)、新增(new)或指定为代表种(assignedastypespecies)等变化。这些变化的主因是因为比较基因组学的发展以及更多噬菌体全基因组被测序，为通过构建进化树来更精细地对病毒进行分类提供了可能。预计基于噬菌体基因组的分类还将持续更新，特别是最为复杂的有尾噬菌体目下的噬菌体。

谢谢观看THANKYOU