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白肌病的发病原因主要有以下几方面：
营养缺乏因素
硒元素缺乏：硒是动物体内维持肌肉正常功能和抗氧化防御系统的关键微量元素，许多抗氧化酶的活性中心含有硒。在土壤硒含量低的地区，植物饲料中硒含量也低，动物长期食用此类饲料，抗氧化能力下降，脂质过氧化反应加剧，过氧化产物在肌肉组织堆积，致使肌肉细胞细胞膜受损，肌肉纤维变性、坏死，从而引发白肌病.
维生素E缺乏：维生素E是重要的抗氧化剂，能保护膜结构完整性。若饲料储存不当，如长期处于高温、高湿环境，或饲料本身维生素E含量低，动物长期食用会使体内抗氧化体系失衡，导致肌肉组织中的线粒体等细胞器损伤，影响肌肉能量代谢，进而引发白肌病.
环境因素
高铜环境：在铜矿开采附近或使用含铜量过高饲料添加剂的养殖环境中，动物易处于高铜环境。适量铜对动物生长有益，但过量铜会产生毒性，高浓度铜离子催化体内氧化还原反应，产生大量自由基，攻击肌肉细胞内生物大分子，破坏肌肉正常结构和功能，引发白肌病.
寒冷应激：在寒冷季节，动物受寒冷刺激，代谢率升高以维持体温恒定，需消耗更多能量和氧气，产生更多自由基。若动物抗氧化能力不足，无法及时清除自由基，且冬季饲料相对单一，缺乏硒和维生素E等抗氧化营养素，就容易患上白肌病.
遗传因素
部分动物品种因遗传因素，对硒和维生素E的吸收、利用能力存在差异，易患白肌病。如某些绵羊品种，其体内负责硒转运的蛋白质结构改变，使硒吸收效率降低，即使饲料中硒含量正常，仍可能出现硒缺乏症状，增加患白肌病风险，且近亲繁殖会使这种遗传易感性更明显.
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