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进出口化妆品中病原菌检测方法微滴式数字PCR法
第5部分:洋葱伯克霍尔德氏菌
2
SN/T5760.5—2024
6设备和材料
除微生物实验室常规灭菌及培养设备外,其他设备和材料如下:
6.1恒温培养箱:36℃±1℃。
6.2冰箱:2℃~8℃、-20℃。
6.3均质器或乳液分散机(转速1000rmin以上)。
6.4电子天平:感量0.1g。
6.5高速微量离心机(最大离心力不小于10000g)。
6.6涡旋振荡仪。
6.7加热装置:95℃-100℃。
6.8核酸蛋白分析仪或紫外分光光度计。
6.9无菌均质袋或均质杯。
6.10生物安全柜。
6.11ddPCR扩增仪及相关配套设备。
6.12移液器及配套吸头:100μL~1000μL、20μL-200pμL、10pL-100pL、0.5μL~10μL。
6.13离心管:2mL、1.5mL和0.2mL。
6.14阳性对照:洋葱伯克霍尔德氏菌ATCC25416或等效菌株或含目的片段的DNA。
7材料和试剂
7.1仅使用分析纯试剂和符合GB/T6682规定的一级水。所有试剂均用无DNA酶污染的容器分装。
7.2DNA提取液:见附录A中A.1。
7.3含多粘菌素B的大豆酪蛋白卵磷脂吐温80(SLDLP)液体培养基:见附录A中A.2。
7.4细菌基因组提取试剂盒。
7.5生理盐水:见附录A中A3
7.6dAPCR反应配套试剂。
7.7洋葱伯克霍尔德氏游1号染色体特异性序列片段参见附录B,引物探针如下:Primer-F:5-cCNTiWCAAGACGTTCGGC-3
Primer-R:5-CITCCGCGGATTCGACAG-3
Probe-P:5-FAM-TCGCCGTCCGCAAGATGCAGG-BHQ1-3
8检验程序
进出口化妆品中洋葱伯克霍尔德氏菌ddPCR检验程序见图1。
SN/T5760.5—2024
图1进出口化妆品中洋葱伯克霍尔德氏菌检验程序
9实验操作步骤
9.1样品前处理
待测的样品应在室温下保存,不要温育、冷藏和冷冻样品。样品的制样处理参照SN/T5075的规定执行。
9.2增菌培养
吸取10mL1:10样品稀释液接种到90mL含多粘菌素B的SCDLP增菌液中,置于36℃±1℃培养箱培养18h~24h。
9.3DNA提取
混匀增菌培养物,在其液面表层吸取1ml.于10000g-12000g离心3min,弃去上清液。必要时,用生理盐水清洗沉淀1次~2次。用1mL生理盐水混悬沉淀,于10000g~12000g离心3min,弃去上清液。在沉淀中加人50μLDNA提取液振荡混匀,于95℃~100℃加热10min,室温冷却2min后,于10000g-12000g离心5min,取上清液作为DNA模板。若不能及时分析,DNA模板可置于-20℃以下冷冻保存备用。
注:若采用商品化DNA提取试剂盒,按其操作说明制备DNA模板。
9.4DNA浓度和纯度测定
样品DNA使用核酸蛋白分析仪或紫外分光光度计测定260nm和280nm处的吸收值A按照公式(1)计算DNA的浓度。
p=Am×Nx50……
和A
…(1)
表1ddPCR反应体系
试剂名称
储备液浓度
终浓度
体积HL
反应预混液
2x
10.0
Primer-F
0μmol/L
090jmal/L
1.8
Primer-R
0μmJ/L
0.90μmol/L
1.8
Pnde-P
0μJL
0.45μmel/L
0.9
DNA模板
一
2.0
水
一
3.5
体系总体积
一
20.0
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SN/T5760.5-2024
附录A
(规范性)
主要培养基和试剂
A.1DNA提取液
A.1.1成分
Chelex-100
灭菌一级水
5.0g
100mL
A.1.2制法
将Chelex-100顺粒加入灭菌一级水中混匀,2℃~8℃保存。
A.2含多粘菌素B的大豆酪蛋白卵磷脂吐温80(SCDLP)液体培养基
A.2.1成分
酪蛋白胨
大豆蛋白胨氯化钠
磷酸氢二钾
葡萄糖卵磷脂吐温80蒸馏水
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