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第十一章
微生物分类和判定;定义:按微生物亲缘关系把它们安排成条理清楚各种分类单元或分类群科学。
任务:
分类
判定
命名;分类:依据一定标准(表型特征相同性或系统发育相关性)对微生物进行分群归类,依据相同性或相关性水平排列成系统,并对各个分类群特征进行描述,方便查考和对未被分类微生物进行判定。
(依据现有数据建立系统过程);判定:借助于现有微生物分类系统,经过特征测定,确定未知、或新发觉、或未明确分类地位微生物所应归属分类群过程。
(依据现有系统确定未知微生物分类归属过程)
命名:是依据命名法规,给每一个分类群一个专有名称。
(分类系统建立过程中步骤之一);第一节通用分类单元;
;新种(sp.nov.或nov.sp.):是指权威性分类、判定手册中从未记载过一个新分离并判定过微生物。新被判定种发表时应在其学名后标上sp.nov.符号。
我国学者筛选到Corynebacteriumpekinensesp.NovAS1.299(北京棒杆菌)
新种发表前应将其模式菌株培养物存放在一个永久性保藏机构,并应允许人们从中取得。;微生物命名
学名:菌种科学名称。
命名标准:
双名法(binominalnomenclature)
学名=属名+种加词+(首次定名人)+(现名定名人和鲜明定名年份)----普通省略
属名在前,普通用拉丁字名词表示,字首字母大写
种名在后,惯用拉丁文形容词表示,全部小写;大肠杆菌:
Escherichiacoli(Migula)CastellanietChalmers1919
若所分离菌株只判定到属,而未判定到种,可用sp来表示.
比如Bacillussp;三名法(trinominalnomenclature)
当某种微生物是一个亚种(subspecies,subsp)或变种(variety,var)时,学名就按三名法拼写,即:
学名=属名+种名+符名subsp或var+亚种或变种加词
苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种
Bacillusthuringiensis(subsp)galleria
酿酒酵母椭圆变种
Saccharimycescerevisiae(var)ellipsoideus;亚种以下分类单元;;第二节微生物在生物界地位;三域学说及其生物进化谱系树;第三节 各大类微生物分类系统纲要;《伯杰氏判定细菌学手册》
(Bergey’sManualofDeterminativeBacteriology);从20世纪80年代末期,该手册更名为:
《伯杰氏系统细菌学手册》
(Bergey’sManualofSystematicBacteriology);真菌界分???系统很多,各国采取不一样系统,比较混乱。近年来为较多人接收是Ainsworth纲要。
粘菌门(Myxomycota)
真菌界鞭毛菌亚门
真菌门(Eumycota)接合菌亚门
子囊菌亚门
担子菌亚门
半知菌亚门;第四节 微生物判定;(一)形态学特征;(二)生理生化特征;(三)核酸碱基组成和分子杂交;1.DNA碱基组成(G+Cmol%);每个生物种都有特定GC%范围,因今后者能够作为分类判定指标。各大类生物GC比范围不一样,有很宽,如细菌;有很窄,如动物。;GC%测定主要用于对表型特征难区分细菌作出判定,并可检验表型特征分类合理性,从分子水平上判断物种亲缘关系。;同一个种内不一样菌株G+C含量差异应在4~5%以下;
同属不一样种差异应低于10~15%;;80年代以前螺菌属(Spirillum)不一样种G+C含量范围宽达38~66%,以后“伯杰氏手册”(1984)结合其它特征已将其分成三个属:螺菌属、海洋螺菌属Oceanospirillum)和水螺菌属(Aquaspirillum)
它们G+C含量分别为38%、42~51%和49~66%;;过去依据形态学特征曾认为微球菌属(Micrococcus)和葡萄球菌属(Staphylococcus)是关系很近两个属,因而长久放在一个科内,因为G+
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