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ADDINCNKISM.UserStyle《药物设计学》课程教学大纲

（理论课程）

一、课程基本信息

课程号

1723S01002

开课单位

药学院

课程名称

（中文）药物设计学

（英文）DrugDesignMethodology

课程性质

选修

考核类型

考查

课程学分

2

课程学时

34

课程类别

专业扩展课

先修课程

大学计算机、有机化学、生物化学

适用专业（类）

药学

二、课程描述及目标

（一）课程简介

《药物设计学》主要讲授研究和开发新药基本技术和手段，是目前药物研究的前沿和热点，也是各大院校药学专业的核心课程。本课程将介绍经典的药物设计的基础知识以及近年来发展起来的有关药物设计的新理论和前沿技术，重点阐述计算机辅助药物设计的基础知识、方法和操作。旨在通过理论教学和实践操作训练，使学生掌握药物设计的基本知识；掌握药物设计的基本原理；具备专业文献阅读的能力，为今后从事药物研发工作奠定一定基础。

（二）教学目标

通过本课程的学习可以掌握药物设计的基础理论和技术，包括药物作用的受体学说，药物与受体作用的方式，以及基于结构的药物设计、基于片段的药物设计等新技术，掌握经典药物设计和目前常用的计算机辅助药物设计的方法，熟悉计算机辅助药物设计的分子图形学工作站有关系统和软件。最后，本课程将指导学生初步了解机器学习等AI技术辅助药物设计的主要内容和方法。

课程目标1：熟悉药物与靶标作用的机制，掌握药物与靶标的作用力类型。

课程目标2：掌握经典药物设计的理论、方法和应用

课程目标3：掌握计算机辅助药物设计的基础知识、理论、技术及现代新理论和新技术在药物设计中的应用

课程目标4：掌握基于信号转导通路的药物设计方法、基于酶和核酸药物设计方法。

课程目标5：加强对当前我国药物研发现在的认识，提升民族自豪感，增强政治认同和文化自信，加强思想道德修养。

三、课程目标对毕业要求的支撑关系

毕业要求指标点

课程目标

权重

1-1：掌握药物化学、药理学、药剂学和药物分析学等学科的基本理论、基本知识和基本技能

课程目标1

课程目标2

课程目标3

0.2

1-4：了解药学及相关学科的发展动态和前沿信息

课程目标3

0.2

2-2：具备从事药物研发、生产、流通、管理、质量控制和药学服务等工作的基本能力

课程目标2

课程目标3

课程目标4

课程目标5

0.3

3-1：具有初步的科学研究和实际工作能力，具有一定的批判性思维能力

课程目标2

课程目标3

课程目标4

课程目标5

0.3

四、教学方式与方法

课堂讲授、翻转课堂、小组讨论、小组互评。

五、教学重点与难点

（一）教学重点

1、药物作用基础及受体学说。2、Lipinski等类药规则概念及应用。3、经典药物设计策略。4、计算机辅助药物设计原理。5、蛋白质三维结构预测法。6、3D-QSAR的常用研究方法。7、分子对接及全新药物设计。8、基于酶、受体、核酸等大分子的药物设计方法。

（二）教学难点

1、受体学说以及药物与受体作用方式。2、受体大分子3D结构的查看与分析。3、分子对接中的优化方法和评价方法。4、药效团模型的建立及基于药效团模型的数据库有哪些信誉好的足球投注网站。

六、教学内容、基本要求与学时分配

序号

教学内容

基本要求

学时

教学

方式

对应课程目标

1

第一章

药物作用的生命科学基础

1.了解药物设计的发展与应用、药物与靶点作用的学说、生物膜与药物跨膜转运概念。

2.熟悉药物作用的生物靶点。

3.掌握诱导契合学说、药物与受体作用力的类型。

2

课堂讲授

课程目标1

2

第二章

经典药物设计方法

1.了解经典药物设计的方法；代谢原理；生物电子等排体的定义与发展；分子杂合原理与孪药概念、应用；组合化学与高通量筛选技术

2.熟悉先导化合物的概念、来源、优化；基于代谢产物发现新药的策略；靶向前药的设计与应用；多靶点药物设计方法。

3.掌握常见生物电子等排体结构、在药物设计中的应用、Me-too药物的概念和设计策略；基于代谢拮抗的药物设计策略；前药设计的原理和方法。

8

课堂讲授

小组展示

课程目标2

3

第三章

计算机辅助药物设计基础

1.了解计算机辅助药物设计的发展与基本概况；分子力场的概念及其适用范围；序列分析与比对和蛋白质结构预测的概念及理论基础；分子动力学模拟方法及结合自由能的计算。

2.熟悉计算机辅助药物设计主要技术、分类、应用；常用软件；常用小分子数据库，蛋白质数据库和药效团数据库。

3.掌握获取分子结构的方法和分子模型的表示方法；大分子3D结构和药物结合模式的分析方法；熟悉；DiscoveryStudio主界面和基础操作；药物分子的结构特征、分子描述符、几何优化、能量优化、分子性质计算和构象分析。

4

课堂讲授

小组展示

实战演练

课程目标3

4

第四章