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芦笋DUF247基因家族成员鉴定及表达分析

芦笋DUF247基因家族成员鉴定及表达分析（1）．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

内容概括．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.2目的和意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

芦笋DUF247基因家族概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

2.1定义与分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

2.2典型特征．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

芦笋DUF247基因家族成员鉴定方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

3.1文献回顾．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

3.2实验设计．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

3.3数据处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

芦笋DUF247基因家族成员表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

4.1RNA-seq数据预处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

4.2启动子区域分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

4.3基因表达水平比较．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

芦笋DUF247基因家族成员功能预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

5.1基于序列比对的方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

5.2基于生物信息学工具的方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

芦笋DUF247基因家族成员调控机制探讨．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

6.1表观遗传修饰研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

6.2细胞信号通路分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

芦笋DUF247基因家族成员在植物生长发育中的作用．．．．．．．．．．．24

7.1生长素响应途径．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

7.2植物激素调节．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

结论与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

8.1主要结论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

8.2展望未来的研究方向．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

芦笋DUF247基因家族成员鉴定及表达分析（2）．．．．．．．．．．．．．．．．．30

芦笋DUF247基因家族概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

1.1定义与分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

1.2生物学特性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

DUF247基因家族在芦笋中的鉴定方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

2.1DNA序列比对．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

2.2RNA-seq数据分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

2.3全基因组扫描．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36

DUF247基因家族的表达模式研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36

3.1基因转录水平．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

3.2细胞定位分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．

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