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ICS65.020.30B41
DB21
辽宁省地方标准
DB21/T2537—2015
蓝舌病病毒荧光PCR检测方法
Methodofthereal-timeRT-PCRforthedetectionofBluetonguevirus,BTV
2015-10-15发布2015-12-15实施
辽宁省质量技术监督局发布
I
DB21/T2537—2015
前言
本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草。本标准由辽宁出入境检验检疫局提出并归口。本标准起草单位:辽宁出入境检验检疫局。
本标准主要起草人:吴斌、万超、孙铭英。
DB21/T2537—2015
蓝舌病病毒实时荧光PCR检测方法
1范围
本标准规定了蓝舌病病毒(Bluetonguevirus)实时荧光PCR检测方法。本标准适用于蓝舌病病毒的检测。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其必威体育精装版版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法
SN/T1193基因检验实验室技术要求
3缩略语
下列缩略语适用于本文件。
Ct值:达到阈值的循环数(CycleThreshold)DEPC:焦碳酸乙二酯(Diethylpyrocarbonate)Taq酶:TaqDNA聚合酶(TaqDNApolymerase)RNA:核糖核酸(RibonucleicAcid)
实时荧光PCR:荧光逆转录聚合酶链反应(RealTimeFluorescentQuantitativeReverseTranscriptionPolymeraseChainReaction)
4原理
采用TaqMan方法,比对蓝舌病病毒基因组S基因的核苷酸序列,设计特异性引物和特异性的荧光双标记探针进行配对。探针5端标记FAM荧光素为报告荧光基团(用R表示),3端标记TAMRA荧光素为淬灭荧光基团(用Q表示),它在近距离内能吸收5端荧光基因发出的荧光信号。PCR反应进入退火阶段时,引物和探针同时与目的基因片段结合,此时探针上R基团发出的荧光信号被Q基因所吸收,仪器检测不到荧光信号;而反应进行到延伸阶段时,Taq酶的5到3的外切核酸酶功能将探针降解。这样探针上的R基团游离出来,所发出的荧光不再为Q所吸收而被检测仪所接收。随着PCR反应的循环进行,PCR产物与荧光信号的增长呈现对应关系。
5试剂和材料
DB21/T2537—2015
除非另有说明,本方法所用试剂均为分析纯,水为GB/T6682规定的一级水;所有试剂均用无RNA酶的容器分装。
5.1试剂
5.4.1DEPC水(见附录A)。
5.4.20.01mol/LPBS(见附录A)
5.4.3Trizol裂解液。
5.4.4三氯甲烷。
5.4.5乳糖蛋白胨缓冲肉汤(BLP,见附录A)
5.4.675%乙醇(见附录A)。
5.4.7异丙醇(-20℃预冷)。
5.4.8其他试剂:荧光PCR反应缓冲液:含50mmol/LKCl(见附录A),10mmol/LTris-HCl(pH8.3)(见附录A),2.5mmol/LMgCl2(见附录A)。可采用等效商品化试剂。
5.4.9dNTPMixture(各10mM)、Taq酶(5U/μL)。
引物:合成一对特异性引物:上游引物5-GTTCTCTAGTTGGCAACCACC-3,下游引物
5-TGCACTGCTCAGCAATCCA-3,TaqMan探针(FAM)5-AGTTCTCGTGGCATTTGCGTAATCC-3(TAMRA)均配制成10umol/L,-20℃保存。
5.2仪器与耗材
5.4.1荧光PCR检测仪。
5.4.2高速台式冷冻离心机(最高可达13000r/min)。
5.4.3微量移液器:0.5μL~10μL,5μL~20μL,20μL~200μL,100μL~1000μL。
5.4.4混匀器。
5.4.5冰箱(2℃-8℃)。
5.4.6研钵。
5.4.7微量可调移液器。
5.4.8离心管。
5.4.9吸水纸。
5.4.10离心管
5.4.11微量带芯吸嘴(10μL,100μL,1000μL)。
6生物
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