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ICS11.220B41
DB21
辽宁省地方标准
DB21/T2549—2015
仔猪乳糖酶基因检测技术规程
Methodofdetectinglactasegeneinpiglets
2015—12—15发布2016—02—15实施
辽宁省质量技术监督局发布
1
DB21/T2549—2015
前言
本标准按照GB/T1.1-2009标准给出的规则制定。附录A、附录B和附录C均为规范性附录。
本标准由辽宁医学院提出。
本标准由锦州市质量技术监督局归口。本标准起草单位:辽宁医学院。
本标准主要起草人:田玉民、苏玉虹、朱弘焱、陶晓丽、王希。
2
DB21/T2549—2015
仔猪乳糖酶基因检测技术规程
1范围
本标准规定了仔猪乳糖酶基因启动子和增强子多态性的检测条件、检测步骤和结果判定的技术要求。
本标准适用于仔猪乳糖酶基因检测。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其必威体育精装版版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T6682-2008分析实验室用水规格和试验方法
GB/T19495.2-2004转基因产品检测实验室技术要求GB/T27476.1-2014检测实验室安全第1部分:总则
3术语和定义3.1
乳糖酶基因Lactasegene,LCT
乳糖酶(LCT)又称β-半乳糖苷酶,在特定条件下将乳糖水解为葡萄糖和半乳糖,进而被消化道吸收。仔猪的乳糖酶基因位于染色体15q13,预测CDS全长为5793bp,在基因序列数据库(GenBank)中的登录号为XM_003359430。
4防污染措施
检测过程中防止交叉污染的措施按照GB/T19495.2第七章规定执行。5安全防护
实验室安全防护按GB/T27476.1第五章规定执行。
6检测条件
6.1实验室条件
按GB/T19495.2中的规定执行。
6.2扩增仔猪乳糖酶基因片段的PCR引物
3
DB21/T2549—2015
扩增启动子SNPG-308C和A-301G片段的PCR引物:
——上游引物F:5-AAAAAGTTTGGTAAGGACCT-3;
——下游引物R:5-GGAACTGTTAGGAGGTATGTG-3扩增增强子SNPG-797A片段的PCR引物:
——上游引物F:5-TAAACAAAGCCAAGGACATT-3;
——下游引物R:5-CTGGGGTGTATGTGCTTGTGG-36.3主要试剂
用水应符合GB/T6682的灭菌双蒸水。
裂解液、10%SDS、饱和酚、TE缓冲液、2×PfuPCRMasterMix、蛋白酶K、凝胶回收纯化试剂盒、测序试剂盒等。具体配制方法参见附录A。
6.4主要仪器
微量移液器、高速冷冻离心机、核酸蛋白测定仪、PCR热循环仪、pH计、精度0.1g分析天平、涡旋混合仪、电泳仪、全自动DNA测序仪等。
7检测步骤
7.1样品的采集
用猪耳号钳子夹取仔猪耳部边缘组织0.5cm3,立即置于装有75%乙醇的1.5mLEp白色塑料管中,-20℃保存备用。
7.2仔猪基因组DNA提取
采用常规的酚-三氯甲烷法提取,并测定DNA溶液浓度。具体方法参见附录B。
7.3乳糖酶基因5UTR区启动子SNPG-308C和A-301G的检测
15μL反应体系:DNA模板50ng、10μmol/L上下游引物各1μL、2×PfuPCRMasterMix7.5μL、加灭菌双蒸水至15μL。可根据需要调整反应体系(注:为保证实验准确性,需设置以灭菌双蒸水为模板的PCR反应作为阴性对照)。PCR扩增产物长度为318bp。
PCR反应循环参数:94℃预变性5min;94℃变性30s,52℃退火30s,72℃延伸30s,30个循环;72℃延伸10min,4℃保存。
用TaKaRaMiniBESTAgaroseGelDNAExtractionKitVer.4.0凝胶回收纯化试剂盒对PCR产物纯化。用TaKaRaMiniBESTAgaroseGelDNAExtractionKitVer.4.0测序试剂盒对PCR产物测序反应。然后在ABI3730XL全
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