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RSRC1在非小细胞肺癌中的表达及生物学作用的探究
摘要
研究目的:
非小细胞肺癌(Non-smallcelllungcancer,NSCLC)是恶性肺肿瘤中最常见的亚
型,也是全球死亡病例最高的癌症。NSCLC容易隐匿发作并迅速转移,导致患者错
过最佳诊疗时机,是其致命原因之一。尽管一些新型疗法如靶向治疗、免疫治疗取
得了很大的进展,但受益人群仍十分有限。因此,探索新的诊断和预后生物标志物,
提高NSCLC的早期诊断和治疗就显得尤为重要。RSRC1基因定位在人类基因组3
号染色体上,编码富含精氨酸与丝氨酸的SR蛋白(serine/arginine-richproteins),在
调控转录过程中发挥重要作用。研究表明SR蛋白在基因的剪接中扮演着多种角色,
异常的SR蛋白表达或功能失调与多种疾病的发生和发展相关联,包括神经系统疾
病、呼吸系统疾病和癌症等。目前尚未有文献报道RSRC1在NSCLC中的作用,因
此,本课题基于生物信息学分析以及调节RSRC1在NSCLC细胞株中的表达,探究
RSRC1在NSCLC中的临床价值和潜在的生物学作用。
研究方法:
1.使用TCGA数据库(TheCancerGenomeAtlas,TCGA)、GEO数据库(Gene
ExpressionOmnibus,GEO)、ULCAN数据库以及在线数据库Kaplan-MeierPlotter分
析RSRC1在肿瘤中的表达以及与NSCLC病人的预后和病理学特征之间的关系。
2.对RSRC1在NSCLC中的共表达基因进行富集分析并使用GeneMANIA在
线网站构建RSRC1的蛋白质网络互作图以了解RSRC1在NSCLC中的生物学功能
以及可能的通路。
3.通过ESTIMATE算法计算RSRC1的表达是否影响NSCLC肿瘤微环境中基
质细胞与免疫细胞的浸润,并进一步评估主要免疫细胞与RSRC1表达的相关性。
4.通过小干扰RNA(smallinterferingRNA,siRNA)转染技术构建RSRC1差异
表达的细胞模型以探索RSRC1在NSCLC发生发展中的生物学功能。通过CCK8、
集落形成实验观察细胞增殖能力的变化;通过Transwell以及划痕愈合实验观察肿瘤
细胞迁移与侵袭能力的变化;使用流式细胞术观察细胞凋亡变化的情况。
结果:
1.RSRC1在包括NSCLC在内的多种肿瘤中表达升高,并且RSRC1的高表达与
NSCLC患者预后不良相关。
2.RSRC1与NSCLC患者的T分期以及N分期显著相关;与LUAD患者M分
期相关;与LUSC患者T分期相关。同时ROC曲线说明RSRC1在NSCLC、LUAD
以及LUSC中均具有良好的诊断价值。
3.RSRC1基因与其共表达基因可能参与调节肿瘤细胞周期、错配修复、mTOR
信号通路以及影响NK细胞毒性等生物学过程。
4.在肺腺癌(Lungadenocarcinoma,LUAD)和肺鳞状细胞癌(Lungsquamouscell
carcinoma,LUSC)中,B细胞和CD4+T细胞的表达与RSRC1呈现负相关;在LUAD
中,CD8+T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和树突状细胞的表达与RSRC1呈正相关;
而在LUSC中,CD8+T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和树突状细胞的表达均与RSRC1
呈负相关。此外,RSRC1的表达与LUAD和LUSC肿瘤微环境的免疫评分、基质评
分和肿瘤纯度密切相关。
5.通过下调RSRC1的表达水平发现,与对照组相比,NSCLC细胞的增殖、迁
移以及侵袭能力均显著下降,同时细胞凋亡比例增多。
结论:
我们的研究表明,与正常组织相比,RSRC1在NSCLC中的mRNA以及蛋白表
达水平均显著升高。RSRC1的表达水平对于NSCLC患者具有重要的预后和诊断价
值。同时,RSRC1的表达水平与NSCLC肿瘤微环境以及免疫浸润密切相关并且可
能参与细胞周期、错配修复以及mTOR通路等。敲低RSRC1之后,NSCLC细胞的
增殖、迁移以及侵袭能力被明显抑制并且凋亡比例增加。RSRC1是NSCLC一种重
要的生物标志物,有成为NSCLC
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