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ICS65.150B51
DB21
辽宁省地方标准
DB21/T2209—2013
海绵种属分子生物学鉴定技术规程
TechnicalSpecificationofIdentifyingSpongethroughMolecularBiologyTechniques
2013-12-12发布2014-01-22实施
辽宁省质量技术监督局发布
I
DB21/T2209—2013
前言
本标准是按照GB/T1.1—2009给出的规则起草的。本标准由大连海洋大学提出。
本标准由大连市质量技术监督局归口。
本标准主要起草单位:大连海洋大学、中国科学院大连化学物理研究所
本标准主要起草人:付晚涛、郑长波、曹旭鹏、苏延明、宋悦凡、潘勍宇、安宗福。本标准于2013年**月**日首次发布。
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DB21/T2209—2013
海绵种属分子生物学鉴定技术规程
1范围
本标准规定了海绵种属分子生物学鉴定的总则、海绵样品采集与保存、海绵种属鉴定方法。本标准适用于海绵的样品采集、保存、处理和种属分子生物学鉴定方法。
2术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。2.1
海绵
海绵(Sponge)是最低等多细胞动物(Metazoan),在动物界中单独构成多孔动物门(PhylumPorifera)。2.2
海绵分子条码
海绵的细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(cytochromeoxidasesubunitⅠ,简称COI)的DNA序列为海绵的保守基因序列信息,作为海绵分子条码。
3总则
3.1原理
海绵细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COI)的DNA序列为海绵的保守基因序列,作为海绵分子条码,用于鉴定海绵种属。通过分子生物学技术——聚合酶链式反应(PolymeraseChainReaction,简称PCR)扩增海绵的COI基因部分序列,测序后与已经鉴定海绵的COI基因序列比对,以此鉴定海绵的种属。
3.2仪器与设备
——野外生物样品保存箱或泡沫保温箱;——高速低温冷冻离心机;
——普通PCR仪;——水浴锅;
——-80℃冰柜。
3.3试剂与材料
——无水乙醇(分析纯);——液氮;
——细胞裂解缓冲液(10mmol/LTris-Cl,pH8.0;1mmol/LEDTA,pH8.0;0.1%(m/V)SDS);——异丙醇(分析纯);
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DB21/T2209—2013
——醋酸甲溶液(60ml5mol/L醋酸钾;11.5ml冰醋酸;28.5ml超纯水);——细胞裂解液(20mmol/LTris-Cl,pH7.6);
——蛋白酶K(20mg/ml);
——TE缓冲液(pH7.6)(100mol/LTris-Cl,pH7.6;10mmol/LEDTA,pH8.0);——超纯水;
——PCR酶(5U/μL);
——10×PCR缓冲液(500mmol/LKCl;100mmol/LTris-Cl,pH8.3;15mmol/LMgCl2,在1.05kg/cm2高压灭菌10min)。
4海绵样品采集与保存
4.1对于潮间带海绵,在海水退潮后,先拍照或摄像,再用金属或木质的小板采集海绵样品于塑料采样瓶中,立刻加入75%乙醇浸没海绵样品并超过2cm以上,然后放入装有冰袋的泡沫保温箱或野外生物样品保存箱,用于分子生物学鉴定。
4.2对于潮下带海绵和深海海绵,采样器采集海绵后放入塑料采样瓶中并在瓶中装满样品附近的海水。装有海绵样品和海水的样品瓶被带上船或带上岸后,倒掉采样瓶中海水,立刻加入75%乙醇浸没海绵样品并超过2cm以上,然后放入装有冰袋的泡沫保温箱或野外样品保存箱,用于分子生物学鉴定。
4.3上述样品均可在4℃条件下保存1天。
4.4海绵样品采集与保存记录于《海绵资源调查采样表》(详见附录A)。
5海绵种属鉴定方法
以海绵的COI基因序列为鉴定海绵种属的分子生物学信息。
5.1海绵DNA提取与纯化
5.1.1取约0.5g保存在乙醇中的海绵样品,放入事先用液氮冷却过的研钵中,加入液氮研磨海绵样品成粉末状。
5.1.2将研磨成粉末的海绵样品移入装有600μL细胞裂解缓冲液的聚丙烯离心管中混匀,加入3μL蛋白酶K,在55℃水浴锅上放置3h以上。
5.1.3从水浴锅取下装有海绵的离心管,放置室温后,加入200μL醋酸钾溶液
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