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DB21T 2631-2016 真鲷虹彩病毒LAMP 检测方法.docxVIP

DB21T 2631-2016 真鲷虹彩病毒LAMP 检测方法.docx

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DB21

辽宁省地方标准

DB21/T2631—2016

真鲷虹彩病毒LAMP检测方法

Loop-mediatedisothermalamplificationdetectionmethodforRedseabreamiridoviralvirus

2016-05-09发布2016-07-09实施

辽宁省质量技术监督局发布

I

DB21/T2631—2016

前言

本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草。

本标准由辽宁出入境检验检疫局提出并归口。

本标准主要起草单位:辽宁出入境检验检疫局。

本标准主要起草人:肇慧君,胡强,刘钊,张达古拉,栾慎顺,张雪。

1

DB21/T2631—2016

真鲷虹彩病毒LAMP检测方法

1范围

本标准规定了真鲷虹彩病毒(Redseabreamiridoviralvirus,RSIV)的环介导恒温扩增(loop-mediatedisothermalamplification,LAMP)检测方法。

本标准适用于RSIV病原的流行病学调查、诊断、检疫和监测。

2规范性引用文件

下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其必威体育精装版版本(包括所有的修改单)适用于本文件。

GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法GB/T18088出入境动物检疫采样

SN/T2123-2008出入境动物检疫实验样品采集、运输和保存规范

3符号代号和缩略语

下列缩略语适用于本文件。

LAMP:环介导恒温扩增(Loop-mediatedisothermalamplification)Betaine:甜菜碱

Bst酶:BstDNA聚合酶(大片段)[BstDNApolymerase(largefragment)]dNTP:脱氧核糖苷三磷酸(deoxyribonucleosidetriphosphate)

4试剂、仪器和耗材

4.1试剂

4.1.1引物

选取特异性的RSIVDPO基因序列,设计出能专一性鉴别真鲷虹彩病毒的特异性引物组,该引物组由如下四条引物组成:

外引物1(F3):5′-AGATGCACTGCTCAAACTCG-3′外引物2(B3):5′-CTGATTGAGAAAGCCGCTCA-3′

内引物1(FIP):5′-CCGCGCATCACTCGATGAACTGCGCTCAAAGAAGGCCGAC-3′内引物2(BIP):5′-CGTGGCCCAGCTGTATGTAGC-TCTCCTCAAGACGGTGGTG-3′

4.1.2商品化DNALAMP法扩增试剂盒。

其中:BstDNApolymerase:8U/μL,-20℃保存,不要反复冻融或温度剧烈变化。

2

DB21/T2631—2016

2×反应缓冲液(RM):含40mMTris-HCL(pH8.8)、20mM氯化钾溶液、20mM硫酸铵溶液、16mM硫酸镁溶液、0.2%Tween-20、1.6Mbetaine(甜菜碱)、2.8mMdNTPs每种。

4.1.3荧光目视染料。

4.2仪器与耗材

4.2.1Loopamp浊度仪:日本荣研化学株式会,型号LA-320C。

4.2.2组织研磨器。

4.2.3普通冰箱和超低温冰箱。

4.2.4反应管:由朗报loopamp提供。

4.2.5移液器:量程0.5μL~10μL,量程10μL~100μL,量程100μL~1000μL。

4.2.6吸头,配套移液器待用。

5生物安全要求

采样、样品处理及检测过程所涉及的实验操作,应遵守SN/T2123-2008的有关规定。

6操作步骤

6.1样本的采集与处理

6.1.1采样

按GB/T18088的标准采集样品。体长小于4cm的鱼苗取整条鱼,体长大于4cm的鱼取脾和肾。

6.1.2样品处理

从病鱼的脾和肾组织采集的样品,按照重量体积1:10的比例,加入0.01mol/LPBS缓冲液(pH7.2),用组织研磨器制备组织匀浆,备用。

6.2RSIV的LAMP检测

6.2.1核酸提取

DNA核酸提取可使用市售商品化的DNA抽提试剂盒对组织匀浆液进行抽提。

6.2.2LAMP反应体系

LAMP扩增反应采用脱氧核糖核酸扩增试剂盒(LAM

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