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小麦耐盐相关NAC转录因子的生物信息与表达分析
目录
小麦耐盐相关NAC转录因子的生物信息与表达分析（1）．．．．．．．．．．．4
内容概览．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.2研究目的．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
1.3研究方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
小麦耐盐相关NAC转录因子的生物信息学分析．．．．．．．．．．．．．．．．．7
2.1数据来源与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
2.2NAC转录因子家族成员鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
2.3NAC转录因子基因结构分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
2.4NAC转录因子保守结构域分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10
2.5NAC转录因子系统发育分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
小麦耐盐相关NAC转录因子的表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
3.1表达数据获取．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13
3.2耐盐处理对NAC转录因子表达的影响．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13
3.3NAC转录因子表达模式分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14
3.4NAC转录因子表达与耐盐性相关性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
NAC转录因子在小麦耐盐性中的作用机制研究．．．．．．．．．．．．．．．．16
4.1NAC转录因子调控下游基因的表达．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
4.2NAC转录因子参与信号转导途径．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
4.3NAC转录因子与耐盐相关代谢途径的关系．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19
讨论与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19
5.1研究结果讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20
5.2研究局限性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21
5.3未来研究方向．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
小麦耐盐相关NAC转录因子的生物信息与表达分析（2）．．．．．．．．．．24
内容简述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
1.2相关概念和定义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25
小麦耐盐相关NAC转录因子概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26
2.1NAC转录因子家族介绍．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26
2.2小麦中NAC转录因子的研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27
生物信息学方法在小麦耐盐研究中的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28
3.1基因组数据库的利用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29
3.2RNA-seq数据分析技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30
3.3转录组数据解释与解读．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
小麦耐盐相关NAC转录因子的鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
4.1数据筛选与预处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33
4.2启动子区域富集分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34
4.3功能注释与分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35
表达模式分析．．．．．．．．．
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