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转录组与小RNA测序：草类性状联合分析新视角

目录

转录组与小RNA测序：草类性状联合分析新视角（1）．．．．．．．．．．．．．．4

一、内容概览．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1转录组与小RNA测序技术的发展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.2草类性状研究的现状与挑战．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.3研究的重要性及预期目标．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

二、研究方法与技术路线．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

2.1研究材料的选择与收集．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

2.2转录组测序技术流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

2.3小RNA测序技术流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

2.4数据处理与分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

2.5联合分析的策略与工具．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

三、草类转录组学研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

3.1转录组测序数据概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

3.2基因表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

3.3差异表达基因的鉴定与功能分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

3.4转录因子与调控网络的研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

四、草类小RNA测序研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

4.1小RNA测序数据概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

4.2小RNA的鉴定与分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

4.3miRNA功能及靶基因分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

4.4小RNA与性状的关联分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

五、草类性状联合分析新视角．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

5.1转录组与小RNA测序的联合分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

5.2遗传变异与表型性状的关联分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

5.3功能性状基因组学研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

5.4草类性状改良的分子机制解析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

六、实践应用与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

6.1实践应用案例分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

6.2技术在草类产业中的应用前景展望结论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

转录组与小RNA测序：草类性状联合分析新视角（2）．．．．．．．．．．．．．28

内容综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

1.2目的和意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

转录组与小RNA测序技术概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

2.1转录组学简介．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

2.2小RNA测序技术介绍．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

草类性状的生物学特性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

3.1草类植物的基本特征．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

3.2草类植物的生长发育过程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．