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藻菌共培养体系微生物生长特性及互作转录组分析

目录

藻菌共培养体系微生物生长特性及互作转录组分析（1）．．．．．．．．．．4

内容概要．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.2研究目的与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.3国内外研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

2.1藻菌共培养体系构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

2.1.1藻类与细菌的选取．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

2.1.2共培养体系的建立．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

2.2微生物生长特性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

2.2.1生长曲线分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

2.2.2生物量测定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

2.2.3代谢产物分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

2.3互作转录组分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

2.3.1样本制备与测序．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

2.3.2转录组数据预处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

2.3.3基因表达量定量．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

2.3.4功能注释与富集分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

结果与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

3.1微生物生长特性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

3.1.1藻类生长特性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

3.1.2细菌生长特性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

3.1.3藻菌互作对生长特性的影响．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

3.2互作转录组分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

3.2.1转录组测序数据质量评估．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

3.2.2基因表达差异分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

3.2.3功能富集分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

3.2.4互作网络构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

藻菌共培养体系微生物生长特性及互作转录组分析（2）．．．．．．．．．26

内容概览．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

1.2文献综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

1.3目的和研究问题．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

2.1实验材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

2.2实验设备与试剂．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

2.3方法步骤．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

2.4数据收集与处理．．．