蛋白质分子设计.ppt

****IPTG:异丙基-β-D-硫代半乳糖苷**************凡是由免疫细胞发挥效应以清除异物的作用即称为细胞免疫。B淋巴细胞受抗原刺激后，经一系列的分化、增殖成为浆细胞，浆细胞产生抗体，抗体进入体液而形成的特异性免疫。****镰孢菌产生的真菌毒素：玉米赤霉烯酮(zearalenone,ZENDON小麦镰刀菌毒素****TrxA基因可编码109个氨基酸的硫氧还蛋白，外源基因经多克隆位点插入后，可与TrxA一起融合表达.融合表达不仅提高了表达产物的稳定性，而且由于相对分子质量增大，用SDS更容易分析鉴定.并可促进目标蛋白的溶解******************************************活性设计是第一步，主要是考虑被研究蛋白质的功能。涉及选择化学基团和化学基团的空间取向。一般选用天然存在的氨基酸来提供所需的化学基团。Scaffold设计指对蛋白质的立体设计。天然蛋白质都是框架化的，参与酶反应的几个重要基团就是他的框架。******例如通过引入二硫键期望提高蛋白质的稳定性，面临的一个问题是怎样选择合适的突变位点。蛋白质中的二硫键具有一定的结构特征，随机选择突变位点引入二硫键会给整个分子带来不利的张力，不但不会提高蛋白质的稳定性，反而会降低蛋白质的稳定性。****************核糖核酸酶T1为一内切核糖核酸酶。它特异地作用于鸟嘌呤核苷酸3端磷酸并切割与相邻核苷酸相连的磷酸二酯键。反应的终产物为鸟嘌呤核苷3磷酸及末端带鸟嘌呤核苷3磷酸的寡核苷酸。去除DNA-RNA杂交体中未杂交的RNA区。**在T4噬菌体溶菌酶中不存在二硫键，只有Cys54和Cys97两个半胱氨酸。MatthewsB.W.等经过仔细的比较和计算设计引入3对二硫键。实验证明所有的突变体在氧化态下均比天然蛋白质更为稳定，另外，Matthews等还研究了Gly和Pro对蛋白质稳定性的影响，发现去除Gly或引入Pro都使突变体的变性温度提高。此外，Matthews等还研究了螺旋偶极的作用，T4溶菌酶含有11个螺旋，其中有7段在N端带负电荷的残基，在剩余的4段螺旋中选择两段螺旋进行N端残基的突变，即Ser38→AsP和Asn144→Asp，每一个突变使得变性温度增加2℃，双突变使得变性温度提高4℃，证明稳定螺旋偶极能够增强蛋白随的整体稳定性。**有机磷中毒事件频发：有机磷进入机体后，与胆碱酯酶结合，使胆碱酯酶失去活性，不能分解乙酰胆碱，从而使组织中的乙酰胆碱大量蓄积，使一些以乙酰胆碱为传导介质的神经处于过度兴奋状态，最后转入抑制和衰竭。****CDS序列：codingsequence编码序列,从起始密码子到终止密码子的所有序列。Plesiomonas毗邻单胞菌属****有机磷水解酶(OPH)是一种生物催化剂,能水解有机磷农药(P—O和P—S键水解)**硒是构成谷胱甘肽过氧化物酶的活性成分，**晶体成像蛋氨酸标记****癌胚抗原（CEA）最初发现于结肠癌和胎儿肠组织中，故名癌胚抗原。97％的健康成人血清CEA浓度在2．5ng／mI以下。CEA升高常见于大肠癌、胰腺癌、胃癌、小细胞肺癌、乳腺癌、甲状腺髓样癌等。CEA超过20ng／ml时往往提示有消化道肿瘤。

但吸烟、妊娠期和心血管疾病、糖尿病、非特异性结肠炎等疾病，15％～53％的病人血清CEA也会升高，

所以CEA不是恶性肿瘤的特异性标志，在诊断上只有辅助价值。这个特别注意。

癌胚抗原（CEA)大于10mg/ml时,才提示有恶性肿瘤的可能****DON小麦镰刀菌毒素****蛋白质的几种超二级结构

αα、ββ、β-α-β、β-α-β-α-β第95页，共122页，星期日，2025年，2月5日从头设计的三股式β折叠从头设计的20个氨基酸残基的三股式β折叠（KortemmeT,etal.1998）（二）蛋白质结构的从头设计实例结构骨架模板、分级迭代算法1mg/110RMB第96页，共122页，星期日，2025年，2月5日ββα型异源四聚体的设计历程结构域替换寡聚化策略异源专一性的计算机重新设计23个氨基酸自动折叠成的锌指结构（ββα5）的核磁共振（NMR）结构(Struthersetal.,1996,1998)；ββα5同源四聚体衍生物ββαT2的X-射线结构（Alietal.,2004)；ββαT