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ICS11.220B41
备案号:41804-2014DB22
吉林省地方标准
DB22/T2010—2014
家畜(猪牛羊)戊型肝炎病毒的测定RT-PCR法
DetectionofHepatitisEvirusbyRT-PCRinLivestock(pig/cattle/sheep)
2014-02-28发布2014-04-30实施
吉林省质量技术监督局发布
1
DB22/T2010—2014
前言
本标准按照GB/T1.1-2009和GB/T20001.4-2001给出的规则起草。本标准由吉林省畜牧业管理局提出并归口。
本标准起草单位:吉林省畜牧兽医科学研究院。
本标准主要起草人:苏双、邵洪泽、许志林、程荣华、王楠、李琳、毛文智、王忠国、李文东,于丹。
2
DB22/T2010—2014
家畜(猪牛羊)戊型肝炎病毒的测定RT-PCR法
警告─使用本标准的人员应有正规实验室工作的实践经验。本标准并未指出所有可能的安全问题。使用者有责任采取适当的安全和健康措施,并保证符合国家有关法规规定的条件。
1范围
本标准规定了家畜(猪牛羊)戊型肝炎病毒RT-PCR测定方法。本标准适用于猪、牛、羊等家畜戊型肝炎病毒的测定。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其必威体育精装版版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。3.1
戊型肝炎病毒HepatitisEvirus[HEV]
戊型肝炎病毒科成员。一种单股正链RNA病毒,呈球形、直径27~34nm,无囊膜,核衣壳呈二十面体立体对称。病毒基因组长约7.2knt,有3个开放阅读框(ORF1、ORF2、ORF3)。ORF2位于3′端,为主要的结构基因编码区,可编码核衣壳蛋白。
3.2
聚合酶链反应polymerasechainreaction[PCR]
聚合酶链反应(PCR)技术是一种在体外快速扩增特定DNA片段的方法。由热变性→复性→延伸三步反应组成一个PCR循环,经过多次循环反应,使目的DNA得以大量扩增。
3.3
反转录reversetranscription[RT]
反转录(RT)是以RNA为模板合成互补DNA(cDNA)的过程。
4试剂与材料
4.1引物
3
DB22/T2010—2014
引物序列见表1,引物浓度为25mmol/L。
表1特异性引物序列
引物种类
引物名称
特异性引物的核苷酸序列
扩增片段长度(bp)
外引物
HEV-1
5-TAYCGHAAYCAAGGHTGGCG-3
524
(第1次PCR引物)
HEV-2
5-TGYTGGTTRTCRTARTCCTG-3
内引物
HEV-3
5-ATWCATGGVTCRCCTGTGAA-3
328
(第2次PCR引物)
HEV-4
5-AAATYAATTCTGTCGGRAGC-3
注:R=A/G,Y=C/T,W=A/T,H=A/C/T,V=A/C/G。
4.2试剂
4.2.1RNA提取试剂盒
4.2.2RT-PCR试剂盒
4.2.3DNA分子质量标准(DNAMarker)
DNA分子质量标准可采用100bpDNAladderMaker、DNAMarkerDL2000或其它等效产品。
4.2.4其它试剂
4.2.4.1双蒸水:符合GB/T6682中4.2二级水要求;
4.2.4.20.1%DEPC水:见附录A中A.1;
4.2.4.375%无水乙醇:见附录A中A.2;
4.2.4.410mg/mL溴化乙锭(EB)或其替代品:见附录A中A.3;
4.2.4.5凝胶加样缓冲液:见附录A中A.4;
4.2.4.61倍Tris-硼酸电泳缓冲液:见附录A中A.5;
4.2.4.7灭菌1mol/L磷酸缓冲盐溶液(PBS):见附录A中A.6。
4.3材料
4.3.1一次性无菌手套或乳胶手套;
4.3.21.5mL离心管;
4.3.30.2mLPCR反应管;
4.3.
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