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第三章核酸化学;;;第三章核酸化学;第一节核酸的化学组成
及其根本结构单位核苷酸;一、核酸的化学组成;一、核酸的化学组成;组成核酸的戊糖有两种:
DNA所含的糖为β-D-2-脱氧核糖;
RNA所含的糖那么为β-D-核糖。;(二)碱基(嘌呤和嘧啶〕;1.常见的嘌呤和嘧啶碱基;2.稀有碱基〔修饰〕;〔三〕核苷〔nucleoside〕;命名,简写符号;;;二、核苷酸〔nucleotide〕
〔一〕脱氧核糖核苷酸;〔二〕核糖核苷酸
;1.核苷单磷酸和多核苷酸〔继续磷酸化〕;2.环化核苷酸;能量通货〔NTP〕
核酸合成的前体
其它物质的前体〔辅酶〕
信号传递〔cAMP、cGMP〕
活化其它物质
参与代谢调节〔别构〕
基因表达的调节〔ppGpp、pppGpp〕;一、核酸的种类、分布及功能;一、核酸的种类、分布及功能;RNA种类;;1.DNA是主要的遗传物质
2.RNA参与蛋白质的生物合成
3.RNA具有多种功能:
1〕控制蛋白质的合成;
2〕RNA转录后加工和修饰;
3〕基因表达与细胞功能调节;
4〕生物催化与其它细胞持家功能;
5〕遗传物质信息的加工和进化;脱氧核糖核酸和核糖核酸异同的比照;二、核酸的一级结构〔共价结构〕;〔二〕核酸一级结构的表示方式;〔三〕DNA一级结构的特点;〔四〕RNA一级结构的特点;3.mRNA和hnRNA的一级结构:
原核生物〔多顺反子〕:一条mRNA链上有多个编码区
真核生物〔单顺反子〕:;真核生物mRNA结构特点;真核细胞mRNA的结构特点;三、DNA的高级结构;;★磷酸与脱氧核糖彼此通过3’,5’-磷酸二酯键相连接,构成DNA分子的主链骨架。;★碱基平面与纵轴垂直,糖环平面与纵轴平行;★每圈螺旋10.4nt,碱基堆积距0.34nm,双螺旋平均直径2nm,
★大沟:宽1.2nm,深0.85nm,
★小沟:宽0.6nm,深0.75nm;双螺旋结构模型〔WatsonCrick模型〕;2.B-型双螺旋结构的实验证据;〔2〕DNA碱基组成的定量分析〔chargaff规那么〕;1)氢键:
2)碱基堆积力:疏水相互作用和范得华力
轴向平行相邻的碱基平面自发地相互靠近,从而使碱基缔合、层层堆积,形成了碱基堆积力,它是使DNA结构稳定的主要力量。
3)离子键:阳离子对磷酸基团的中和;双链的互补性对于揭示和理解DNA的复制、重组、修复以及转录过程有重要意??,揭开了分子生物学研究的序幕。;5.DNA的其它二级结构类型;1〕A型结构和Z型结构
;反向重复序列与镜像结构
;反向重复序列中的单链可形成发夹结构
;反向重复序列可形成十字架结构
;4)三股螺旋;H-DNA:
三条链局部螺旋;5)四链螺旋;
DNA的三级结构主要有以下三种:
;;;〔三〕DNA与Pr的复合体;*;核小体的电镜照片;核小体:
1〕组蛋白核心八聚体:
2H2a2H2b2H32H4,结构相似有共同起源。
2〕约146bp的DNA左旋缠绕组蛋白核心八聚体1.65圈
3〕连接者:H1,核小体连接
4〕连接DNA:8-144bp,平均55bp;大多数天然RNA分子是以一条单链形式存在的,但在生理条件下,RNA分子也可以形成双螺旋区,发卡式结构,茎-环结构等二级结构。这样的结构一般都出现在tRNA和rRNA分子中,RNA的双螺旋区的结构类似于A-DNA的结构。;〔1〕占总RNA的15%
〔2〕含有较多修饰成分
〔3〕3′-末端都具有CCAOH
〔4〕5′-末端pG
〔5〕绝大多数tRNA经过折叠形成4茎和4环组成的特征性三叶草形二级结构。
〔6〕倒L型三级结构;tRNA三叶草二级结构
(四臂四环);在tRNA二级结构中未配对的某些并不互补的碱基参与了三级结构中特殊的氢键作用;
tRNA链中的核糖-磷酸骨架与某些碱基甚至其他的骨架之间也能产生作用。;占总RNA的80%;16SrRNA的二级结构;5SrRNA的二级结构;〔三〕mRNA等其他RNA的高级结构;一、核酸的性质;1OD260DSDNA50?g/ml
SSDNA35?g/ml
RNA40?g/ml;DNA分子的变性;DNA的变性在紫外吸收上的变化;5.影响Tm的因素
1〕DNA的均一性越高,Tm的温度范围越小。
2〕G-C含量越高,Tm的值越大,当GC的含量上升1%,那么Tm上升0.4℃。马默多蒂〔Marmur-Doty〕关系式:
Tm=69.3+0.41(G+C)%,或GC%=〔Tm-69.3〕×2.440;5.影响Tm的因素
1〕D
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