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爱必信多色分析服务--HALO病理图像分析
病理检查一直被誉为疾病诊断的“金标准”,是认识疾病本质的理论基础,病理学诊断在医学诊断中常被认为是“权威诊断”,意义重大。但传统的病理诊断
面临着主观因素大,缺乏客观数据;效率低,耗费大量时间;没有精准的统计,重复性低等缺陷。为此,科学家们也一直在寻求和创造新的分析技术及方法:
数字病理,全切片影像系统,机器学习,人工智能
病理诊断的工作很复杂,但是病理图像分析的流程却很简单:从标准化制片到染色、扫描成全切片数字图像、再到最后的图像分析及管理和共享,前面的三步
随着设备升级、技术发展已经能够高效率进行。最后一步的切片观察难度依然很大,现阶段需要凭靠病理学家们丰富的科研经验进行判断,如遇到大批量一起
的切片,就非常耗费时间与人力。
多色老师:我成像完了以后想要做数据分析,你们有什么软件推荐吗?
小爱:目前市面上数据分析软件还是比较多的,像免费的您可以下载imageJ、Qupath,缺点就是用法都需要您自行摸索;我们公司安装的是HALO和
StrataQuest两款软件,HALO病理图像分析平台,StrataQuest是我们TG的扫描仪平台自带的(基本所有的病理领域的分析需求都能满足,可以出组织流式
散点图,直方图),从功能、分析的精准度和可操作性来说,肯定是大大优于开源软件的,且有软件专业的技术支持团队能够答疑解惑。您可以根据您的实际
情况选择合适的分析软件,如果您实在无从下手,也可以找Absin,我们可以提供数据分析的服务~
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那么接下来小爱给大家介绍的HALO,就是针对病理诊断的难点痛点而诞生的一个精准简便的病理图像分析平台。HALO可兼容市场上大多数扫描仪扫出的图
像文件格式(LEICA,Hamamatsu,3DHistech,Zeiss,Akoya,KFBIO,JPG,TIFF),这些图像可直接导入HALO软件,无需任何格式转换即可进行编辑和分
析。广泛的应用于神经科学、代谢组学、肿瘤学、毒理病理学等领域的病理图像定量研究中。
mIHC定量分析内容:
总分析区域的细胞数/细胞核数,各marker细胞数/细胞核数,各marker细胞数目/细胞核数占比,各marker阳性细胞平均荧光强度值,每平方微米的平均
细胞数/细胞核数,面积计数及多染细胞的共定位信息等...
mIHC空间分析内容:
(a)最近邻分析(b)邻近度分析(c)浸润分析(d)密度热图分析
1、最近邻分析(NearestNeighbor):确定任何两个单元格或对象群之间的平均距离和唯一邻居的数量。
1)类群A数量【PopulationACells】–检测到的类群A的总数。
2)到类群B的平均距离【AverageDistance(µm)toPopulationB】(μm)–类群A到类群B的平均距离(μm)。
3)唯一类群B的数量【NumberofUniquePopulationB】–检测到的唯一类群B的总数。
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2、邻近度分析(ProximityAnalysis):计算与另一个对象或单元格一定距离内的单元格或对象的数量。
1)类群A数量【PopulationACount】–检测到的类群A的总数。
2)类群B数目【PopulationBCount】–检测到的类群B的总数。
3)在类群A输入范围内的类群B的数量【PopulationAwithininputrangeµmofPopulationB】–在类群A的输入范围内
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