三、DNA结合基序课件.pdf

3、DNA结合基序

•对各种转录因子的序列进行比较，可发

现其基序（motif）的共同点是都DNA

结合。

•基序通常很短，仅为蛋白质结构的一小

部分。

典型的DNA结合基序包括：

•锌指结构(zincfinger)基序

•螺旋-环-螺旋(helix-loop-helix,HLH)

•亮氨酸拉链(leucinezipper)

锌指基序

.锌指基序是由保守氨基酸的小基团与锌

离子结合形成类似手指状的DNA结合结

构域。

.锌指基序是DNA结合蛋白的一个通用基

序，锌指结构通常由相对独立的结构域

串连重复排列在一起而形成。

•通用转录因子SP1有一个DNA结合域,

含3个锌指基序。

Figure21.4Zincfingersmayformx-helicesthat

insertintothemajorgroove,associatedwithp-sheets

ontheotherside.

B-Rhd汶cc-helix

Figure21.5Thefirstfingerofasteroidreceptor

controlsspecificityofDNA-binding(positionsshownin

red);thesecondfingercontrolsspecificityof

dimerization(positionsshowninblue)Theexpanded

viewofthefirstfingershowsthatdiscrimination

betweenGREandEREtargetsequencesrestsontwo

aminoacidsatthebase

A颈

A砌

GlucocorticoidEstrogen

specificityspecificity

QSamesequenceinbothreceptors

Differentsequenceineachreceptor

y

•已知的锌指结构主要发现于促进RNA聚合

酶II和RNA聚合酶III转录的转录因子中。

•典型的锌指蛋白一TFIIA5SrRNA基因及

产物5srRNA都结合。

螺旋-环-螺旋结构

•此基序长40-50个氨基酸残基，其中含两

个既亲水又亲脂的a-螺旋,a-螺旋被不同

长度的环（连接区）分开。

•大多数HLH蛋白有一HLH基序相邻的强碱

性的区域，它是DNA结合必需的，含有

此区的HLH称为bHLH蛋白。

Figure21.13AllHLHproteinshaveregionscorrespondingtohelix1andhelix2,separatedbyak）叩of1024

residuesBasicHLHproteinshavearegionwithconservedpositivechargesimmediatelyadjacenttohelix1

MyoDAlaAspArgArgLysAlaAlaThrMetArgGinArgArgArgBasicregion

IdArgLeuProAlaL