二三代测序技术的介绍和比较.pptx

二代和三代测序技术的介绍与比较;;;测序成本;二代测序技术;二代测序技术—Illumina;Illumina测序仪比较;Illumina测序仪的选择;二代测序—Roche454;二代测序—Solid;表征复杂免疫区域的扩增单体型。通过检测相邻两个碱基之间的测序时间，来检测一些碱基修饰情况，可以通过这个来之间检测甲基化等信息。靶向检测基因或大型基因组的特定区域，直接检测其变异，揭示耐药机制。通过对Iso-form多样性的完整检测（包括基因融合、剪接位点和内含子等）发现癌症样本中隐藏的生物学机制。;二代测序—分析流程;二代测序—分析流程;;二代测序—肿瘤研究;队列分析—案例;三代测序;三代测序—SMRT;三代测序—Nanopore;Nanopore主要特点;三代测序—IonTorrent;IonTorrent—shortreads;IonTorrent—longreads;获得全长HLA等位基因变异而无插补。测序错误率比较高，通过多次测序纠错。表征复杂免疫区域的扩增单体型。在单次实验中进行完整的微生物基因组测序。通过对Iso-form多样性的完整检测（包括基因融合、剪接位点和内含子等）发现癌症样本中隐藏的生物学机制。;三代测序技术应用;三代测序在肿瘤研究中的应用;三代测序—研究热点;二代测序技术的比较;通过检测相邻两个碱基之间的测序时间，来检测一些碱基修饰情况，可以通过这个来之间检测甲基化等信息。不需要昂贵的物理成像等设备，成本相对较低，体积小，操作简单。快速，除了2天文库制作时间，整个上机测序可在2-5小时内完成。不过整个芯片的通量并不高，目前是10G左右，适合小基因组和外显子验证的测序。???