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基于NGS的微生物多组学在人体微生态领域的应用.pptx

基于NGS的微生物多组学在人体微生态领域的应用.pptx

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;Contents;人体微生态介绍及研究思路;人体微生态;人体微生态;如何定义健康菌群?;口腔

食管

小肠;;肠道菌群文章发表趋势;微生物研究动态;人类微生物计划

HumanMicrobiomeProject

简称:HMP;微生物研究国际计划;;;基因测序;基因测序;宏基因组测序();基于的微生物研究技术比较;多样性分析宏基因组技术的区别;独有技术;如何理解精准宏基因组测序?;技术优势;研究目的

鉴定微生物群落中新微生物;单细胞层级上的重测序。

研究策略

流式细胞分选特定微生物单细胞,进行MDA扩增后进行初步筛选;对候选样本进行建库测序分析,最后对新物种鉴定与验证。

针对某些难以培养的微生物也可以进行基因组层面的重测序分析。;研究思路—;研究思路—;研究流程;取样策略();欲解决的问题;人体微生态经典案例解析;肠道菌群经典案例解析;肠道是人体微生态菌群分布重要场所;肠道微生物与人类疾病;影响肠道微生态的因素;影响肠道微生态的因素;肠道菌群与致病性之间的关系;肠道微生态的研究的材料;、肠道菌群与癌症—;、肠道菌群与癌症:;、肠道菌群与癌症;研究结果展示;研究结果展示;、肠道菌群与炎症性肠病;研究结果展示;研究结果展示;、肠道菌群与血栓;研究结果展示;研究结果展示;研究结果展示;、肠道菌群与肥胖:;、肠道菌群与肥胖;、肠道菌群与肥胖;研究结果展示;、肠道菌群与抗生素抗性;研究结果展示;研究结果展示;人体其它微生态案例解析;皮肤微生物;皮肤菌群里的有益菌和抗菌肽对抗皮炎;;;生殖道微生物;研究结果展示;研究结果展示;血液微生物;研究结果展示;尿液微生物;研究结果展示;肺组织微生物;研究结果展示;研究结果展示;人体微生态四大研究方案;;生物标记物挖掘;儿童肠道菌群在形成Ι型糖尿病的作用;肠道微生物群落和代谢通路的变化;肠道菌群特征“识别”Ⅰ型糖尿病症状;寻找结直肠癌非侵入式生物标记物;研究结果展示;研究结果展示;口腔微生物预测幼儿龋齿的发生;通过信息分析发现个物种能够预测或判断

龋齿的发生;菌株水平研究;菌株水平研究人体疾病的技术方案;取样方式:

个参试者,其中超重:肥胖,男性:女性;处理:周(???饮食周()饮食;

检测:本底水平和处理后粪便中菌丰度、粪便微生物基因丰度、饮食和生物参数(、血脂、、、、、、、脂多糖及一些酶等)。;研究结果展示;研究结果展示;研究结果展示;全微生物组关联分析;...;样本情况:

个未治疗病人和个健康人:例粪便样本;个病人和个健康人:个牙菌斑样本;来自个病人和个健康人:个唾液样本。

其中有个病人经过药物治疗。

测序策略:

宏基因组分析:插入片段大小,,;

粪便样本产生:;

口腔样本产生:。;研究结果展示;研究结果展示;研究结果展示;多组学联合分析;多组学分析策略;测序技术及策略:

肠道内容物样本技术:

宏基因组测序

宏转录组测序(去除率达到)

重复()宏转录组数据库

粪便样本技术:

宏转录组测序()

组织学特征检查;宏基因组宏转录组数据小鼠肠道的功能;研究结果展示;基因组转录组蛋白组代谢组;微生物多组学研究方案;谢谢!

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