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河北杨PhMYB14基因克隆与生物信息学分析研究.docx

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河北杨PhMYB14基因克隆与生物信息学分析研究

河北杨PhMYB14基因克隆与生物信息学分析研究（1）．．．．．．．．．．．．．3

一、内容概览．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

二、河北杨的生物学特性及基因组概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

河北杨的生物学特性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

河北杨基因组概况．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

河北杨基因研究的意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

三、PhMYB14基因的克隆与表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

PhMYB14基因的克隆．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

PhMYB14基因的表达模式．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

PhMYB14基因的功能预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

四、生物信息学分析方法的介绍与应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

生物信息学概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

生物信息学分析方法的分类与应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

本研究中的生物信息学分析方法及流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

五、河北杨PhMYB14基因的生物信息学分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

PhMYB14基因序列分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

PhMYB14基因的表达谱分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

PhMYB14基因的进化分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

PhMYB14基因与其他相关基因的关系分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

六、河北杨PhMYB14基因的功能研究及实验验证．．．．．．．．．．．．．．．．．26

PhMYB14基因的功能预测及分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

功能验证实验的．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

实验结果的分析与讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

七、结论与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

研究成果总结．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

研究限制与不足．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

未来研究方向与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

河北杨PhMYB14基因克隆与生物信息学分析研究（2）．．．．．．．．．．．．36

一、内容简述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

1.2文献综述与研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

二、材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

2.1实验材料准备．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40

2.1.1植物材料的选择．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41

2.1.2主要试剂及设备．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42

2.2基因克隆技术路线．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43

2.2.1RNA提取与cDNA合成．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44

2.2.2引物设计与PCR扩增．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45

2.2.3克隆鉴定与序列分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46

2.3生物信息学分析方法．．．．．．．．．．．．．

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