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基因工程中
限制酶的选择
1.定义1970年,阿尔伯(W.Arber)、内森斯(D.Nathans),史密斯(H.C.Smith)在细菌中发现了第一个限制性内切酶(简称限制酶)后,20世纪70年代初相继发现了多种限制酶和连接酶,以及逆转录酶,这些发现为DNA的切割、连接以及功能基因的获得创造了条件。2.来源主要从原核生物中分离纯化出来的限制性内切核酸酶——“分子手术刀”切割DNA分子的工具是限制性内切核酸酶,又称限制酶
3.作用特点(1)能够专一性识别双链DNA分子的特定核苷酸序列;一般由6个核苷酸组成,也有少数限制酶的识别序列由4个、8个或其他数量的核苷酸组成。(2)使每一条链中特定部位的磷酸二酯键断开。EcoRI限制酶5′GAATTC3′
EcoRI(在G与A之间切割)SmaI(在G与C之间切割)5555333355335533黏性末端平末端
4.作用结果(1)黏性末端限制酶在它识别序列的中心轴线两侧,将DNA分子的两条链分别切开时,产生的是粘性末端。经限制酶切割产生的DNA片段末端通常有两种形式,黏性末端和平末端。5′AATT3′
(2)平末端限制酶在它识别序列的中心轴线处切开时,产生的是平末端。
(1)不破坏目的基因原则:酶切位点位于目的基因的两端,应选择切点位于启动子、终止子之间的酶。如图甲中可选择PstⅠ,而不选择SmaⅠ。5.图解限制酶的选择原则
注:图中限制酶的识别序列及切割形成的黏性末端均不相同。?????A.NdeⅠ和BamHⅠ????B.NdeⅠ和XbaⅠ?????C.XbaⅠ和BamHⅠ???D.EcoRⅠ和KpnⅠA典型例题1.如图为某质粒限制酶酶切图谱。某基因不含图中限制酶识别序列。为使PCR扩增的该基因与该质粒构建重组质粒,则扩增的该基因两端需分别引入哪两种限制酶的识别序列(??)
(2)保留标记基因、启动子、终止子、复制原点原则:质粒作为载体必须具备标记基因,所以所选择的限制酶尽量不要破坏这些结构,如图乙中不选择SmaⅠ。
质粒A中没有标记基因,质粒B的复制原点中含有HindⅢ酶切位点BamHⅠ和HindⅢ2不含有质粒A中没有标记基因,质粒B的复制原点中含有HindⅢ酶切位点BamHⅠ和HindⅢ2不含有
(3)确保出现相同黏性末端原则:通常选择与切割目的基因相同的限制酶,如图甲中PstⅠ;为避免目的基因和质粒自身环化和随意连接,也可使用不同的限制酶切割目的基因和质粒,如图甲也可选择PstⅠ和EcoRⅠ两种限制酶。
①先用NdeI和XhoI酶切质粒2和空载体,将两种酶切产物连接获得连接产物。②用NcoI和MseI酶切质粒1,用Ncol和Ndel酶上一步中的连接产物,将两种酶切产物连接获得基因表达载体。3.现需要构建同时含有mLDH、FDH的基因表达载体。请你根据下图,提出将两个基因依次连入载体的思路___________(要体现选用的内切酶和连接的先后顺序)。
(4)还要注意转录方向。
A.用EcoRⅠ切割目的基因和P1噬菌体载体B.用BglⅡ和EcoRⅠ切割目的基因和P1噬菌体载体C.用BglⅡ和Sau3AⅠ切割目的基因和P1噬菌体载体D.用EcoRⅠ和Sau3AⅠ切割目的基因和P1噬菌体载体D4.若要利用某目的基因(见图甲)和P1噬菌体载体(见图乙)构建重组DNA(见图丙),限制性内切核酸酶的酶切位点分别是BglⅡ(A↓GATCT)、EcoRⅠ(G↓AATTC)和Sau3AⅠ(↓GATC)。下列分析合理的是(??)
巩固练习1.从图1酶切结果分析,图2中目的基因(长度为2.0kp)插入方向正确的重组质粒序号和作出该判断所用的限制酶是()?A、①,BamHⅠB、①,EcoRⅠ和HindⅢC、②,EcoRⅠD、②,EcoRⅠ和HindⅢ1.34.52.33.5B
2.要在乳酸杆菌中表达W基因,需使用图1中的质粒为载体。图2为克隆得到的含W基因的DNA片段,W基因以乙链为转录模板链。①启动子往往具有物种特异性,在图1质粒中插入W基因,其上游启动子应选择_______(填字母)。A.枯草芽孢杆菌启动子B.乳酸杆菌启动子C.农杆菌启动子②下表是几种限制酶的识别序列及其切割位点,图1、图2中标注了相关限制酶的酶切位点。
限制酶EcoRIBamHIKpnIMfeIHindⅢ识别序列及切割位点为获得能正确表达W基因的重组质粒,应选用限制酶____________切割图1中的质粒,选用限制酶____________切割图2中含W基因的DNA片
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