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基于转录组数据分析促进烟草脯氨酸积累的机制

目录

基于转录组数据分析促进烟草脯氨酸积累的机制（1）．．．．．．．．．．．．3

内容描述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.2文献综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

材料和方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

2.1实验材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

2.2实验方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

2.3数据处理与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

烟草转录组数据概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

3.1转录组数据的收集．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

3.2转录组数据的预处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

3.3转录组数据的统计特征．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

转录组数据与脯氨酸代谢的关系．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

4.1脯氨酸代谢途径概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

4.2转录组数据与脯氨酸代谢途径的关联分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

基于转录组数据分析烟草脯氨酸积累的机制．．．．．．．．．．．．．．．．．19

5.1关键基因的筛选与功能注释．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

5.2关键基因表达模式的分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

5.3关键基因在脯氨酸积累中的作用验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

结果讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

6.1关键基因对脯氨酸积累的影响．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

6.2转录组数据揭示的生物学意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

结论与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

7.1主要发现．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

7.2研究的局限性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

7.3未来研究方向．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

基于转录组数据分析促进烟草脯氨酸积累的机制（2）．．．．．．．．．．．31

一、内容概要．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

1.2研究目的与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

1.3研究方法与技术路线．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

二、烟草脯氨酸积累的生物学基础．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

2.1脯氨酸的生理功能．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

2.2脯氨酸在烟草中的代谢途径．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38

2.3影响烟草脯氨酸积累的因素．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

三、转录组数据收集与分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41

3.1转录组数据来源与采集．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42

3.2数据处理与标准化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43

3.3转录组数据分析流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45

四