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ICS67.060
B21
DB37
山东省地方标准
DB37/T3104—2018
向日葵杂交种品种纯度SSR分子检测标准
ThevarietypurityidentificationtechniqueofsunflowerseedswithSSR
2018-02-02发布2018-03-02实施山东省质量技术监督局发布
I
DB37/T3104—2018
前言
本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草。本标准由山东省农业厅提出。
本标准由山东省农业标准化技术委员会归口。
本标准主要起草单位:山东农业大学、北京德农种业有限公司。本标准起草人:张春庆、赵洪春、郑建鹏、温大兴、李岩。
本标准为首次发布。
1
DB37/T3104—2018
向日葵杂交种品种纯度SSR分子检测标准
1范围
本规程规定了SSR分子检测向日葵种子纯度的试剂配比、DNA提取、SSR引物选择、多重PCR方法、PCR产物检测等技术要求。
本规程适用于向日葵品种和杂交种种子纯度的室内快速鉴定。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其必威体育精装版版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB3543种子检验技术规程
GB20464农作物种子标签通则
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1
杂交种
各种直接用于生产的杂交向日葵一代种子。
3.2
品种纯度
品种在特征特性方面典型一致的程度,用本品种的种子数占供检本作物样品种子数的百分率表示。
3.3
标准样品
能够充分代表种或品种特征特性的种子样品,或具备指定特征、特性样品。
3.4
引物
一条互补结合在模板DNA链上的短单链,能提供3-0H末端作为DNA合成的起始点,延伸合成模板DNA的互补链。
4原理
2
DB37/T3104—2018
从向日葵种子中提取DNA,利用SSR引物进行PCR扩增,不同碱基长度的PCR扩增引物通过聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,并通过染色显示DNA指纹谱带类型。不同向日葵品种由于遗传组成不同,基因组中DNA简单重复序列的重复次数有差异,这种差异可通过PCR扩增、电泳、染色程序获得的DNA指纹图谱加以区分,从而对不同品种进行鉴定。杂交种纯度鉴定时,可从附表中选取亲本有差异的SSR引物。品种纯度鉴定时,从附表中选择生产上常用品种间有差异的引物。
5仪器与试剂
5.1仪器
电子天平,水平摇床,双垂直板电泳槽,PCR仪,电泳仪,高压灭菌锅,观片灯。
5.2试剂
丙烯酰胺、甲叉双丙烯酰胺、谷氨酸、乙二胺四乙酸二钠、硼酸、过硫酸铵、四甲基乙二胺(TEMED)、氢氧化钠、氢氧化钾、甲醛、2×PowerTaqPCRMasterMix、超纯水、SSR引物、硝酸银(所用试剂均为分析纯,所用水均为去离子水)。
6溶液
6.1提取液
称取0.56g氢氧化钾于100mL烧杯中,加去离子水溶解并定容至100mL,4℃贮存备用。
6.230%凝胶溶液
称取292g丙烯酰胺于1000mL烧杯中,加去离子水溶解,再加入8g甲叉双丙烯酰胺,溶解后定容至1000mL,4℃贮存备用。
6.35×TBE
称取54gTris、3.72g乙二胺四乙酸二钠、27.5g硼酸于1000mL烧杯中,溶解后定容至1000mL。
6.4催化剂
称取10g过硫酸胺于100mL烧杯中,加去离子水溶解并定容至100mL,4℃贮存备用。
6.5电极缓冲液
取5×TBE200mL,用去离子水定容至1000mL。
6.6染色液
称取1g硝酸银溶于500mL去离子水中。
6.7显色液
称取10g氢氧化钠溶于500mL去离子水中,用时加2mL甲醛。
7操作程序
3
DB37/T3104—2018
7.1DNA提取
从送验样品中随机数取向日葵种子200粒,将种子剥壳后纵切,放入1.5mL离心管中,加入300μL提取液,提取时间1min~24h均可,使用前混匀、静止5分钟、离心3000rpm,0.5min,取上清即为DNA样品,用于PCR扩增时DNA样品模板量为2μL。
7.2扩增体系
采用20μL扩增体系,其中每对U-primers的上下游引物(10μM)各0.5μL,2μL25mmol/LMgCl?,0.2μL5U
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