线虫鉴定通用引物.pdf

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TheprimerpairsusedwereD2A(5’-acaagtaccgtgagggaaagttg-3’)andD2B

(5’-aatccgtgtttcaagacggg-3’),D3A(5’-gacccgtcttgaaacacgga-3’)andD3B

(5’-tcggaaggaaccagctacta-3’)(Nunn,1992),andmtA(5’-ggcggatcctacatcgatgttgtat-3’)andmtB

(5’-ggcggatccwkttcctctcgtact-3’).TheseprimersselectivelyamplifymetazoanribosomalDNAs

(rDNA)anddonotamplifycommoncontaminantssuchasbacteria,fungi,orplantmaterial.

CourtrightEM,WallDH,VirginiaRA,etal.NuclearandmitochondrialDNAsequencediversityin

theAntarcticnematodeScottnemalindsayae.JournalofNematology,2000,32(2):143.

DNAextractionandpolymerasechainreaction(PCR)assayswereperformedaccordingto

Subbotinetal.(2000).TheITS1-5.8S-ITS2andtheD2-D3of28SofrDNAwereamplifiedusing

thefollowingprimersets:5367(5’-ttgattacgtccctgcccttt-3’)andF195(5’-tcctccgctaaatgatatg-3’);

andD2A(5’-acaagtaccgtgagggaaagttg-3’)andD3B(5’-tcggaaggaaccagctacta-3’)asdescribedby

Schmitzetal.(1998)andDeLeyetal.(1999),respectively.

CastilloP,VovlasN,SubbotinS,etal.Anewroot-knotnematode,Meloidogynebaetican.

sp.(Nematoda:Heteroderidae),parasitizingwildoliveinSouthernSpain.Phytopathology,2003,

93(9):1093-1102.

D3A(5’-gacccgtcttgaaacacgga-3’)andD3B(5’-tcggaaggaaccagctacta-3’).

Al-BannaL,PloegAT,WilliamsonVM,etal.DiscriminationofsixPratylenchusspeciesusing

PCRandspecies-specificprimers.Journalofnematology,2004,36(2):142.

Thenuclearribosomalinternaltranscribedspacer(ITS1)segmentwasamplifiedwiththeprimers

rDNA25’-ttgattacgtccctgcccttt-3’(Vrainetal.1992)andrDNA1.58S5’-acgagccgagtgatccaccg-3’

(Cherryetal.1997).TheribosomalLSUD2-D3expansionsegmentwasamplifiedwithprimers

D2A5’-acaagtaccgtgagggaaagttg-3’andD3B5’-tcggaaggaaccagctacta-3’(Courtrightetal.,2000)

aspreviouslydescribed(Al-Bannaetal.,1997).

SkantarAM,CartaLK.Multipledisplacementamplification(MDA)oftotalgeno

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