微生物的分类和鉴定.pptVIP

3、微生物的快速鉴定和自动化分析技术微量多项试验鉴定系统（简易诊检技术，数码分类鉴定法）：针对微生物的生理生化特征，配制各种培养基、反应底物、试剂等，分别微量(约0.1ml)加入各个分隔室中(或用小圆纸片吸收)，冷冻干燥脱水或不干燥脱水，各分隔室在同一塑料条或板上构成检测卡。试验时加入待检测的某一种菌液，培养2-48小时，观察鉴定卡上各项反应，按判定表判定试验结果，用此结果编码，查检索表(根据数码分类鉴定的原理编制成)，得到鉴定结果，或将编码输入计算机，用根据数码分类鉴定原理编制的软件鉴定，打印出结果。API细菌数值鉴定系统‘Enterotube’系统‘Biolog’全自动和手动细菌鉴定系统微生物鉴定系统及其反应原理*系统反应分析阳性结果显示系统例子pH基础反应（多为15～24hr）碳源利用pH指示剂颜色变化；碳源产酸、氮源产碱API;Crystal;VITEK;MicroScan酶谱（多为2～4hr）微生物已有的酶无色复合物被适当酶水解时，色源/荧光源释放引起颜色变化MicroScan;IDS(Remel)碳源利用有机产物因转移电子至无色四氮唑标记碳源使染料变为紫色Biolog挥发或非挥发酸检测细胞脂肪酸以检测代谢产物为基础的层析技术，与数据库中的资料相比较MIDI生长可见检测不同底物微生物利用某一底物产生浊度酵母样菌鉴定核酸的碱基组成和分子杂交特点：与形态及生理生化特性的比较不同，对DNA的碱基组成的比较和进行核酸分子杂交是直接比较不同微生物之间基因组的差异，因此结果更加可信。DNA的碱基组成(G+Cmol%)DNA碱基因组成是各种生物一个稳定的特征，即使个别基因突变，碱基组成也不会发生明显变化。分类学上，用G+C占全部碱基的克分子百分数(G+Cmol%)来表示各类生物的DNA碱基因组成特征。123456二、微生物分类鉴定中的现代方法每个生物种都有特定的GC%范围，因此后者可以作为分类鉴定的指标。细菌的GC%范围为25--75%，变化范围最大，因此更适合于细菌的分类鉴定。分类学的基本任务有3个，即分类（classification）、鉴定（identification）和命名（nomenclature）。广谱降解染料俗名—commonname简洁易懂，方便记忆，但涵义往往不够准确，还有适用范围和地区性的限制。命名—scientificname菌种的科学名称。菌种的学名是按照《国际细菌命名法规》命名的国际学术界公认，并通用的名称。命名原则：学名=属名+种的加词+（首次定名人）+现名定名人和鲜明定名年份规定与常识：属名应大写首字母、单数、可以组合外而成。种的加词代表一个种的次要特征，首字小写MicroScan根据相拟性和表型特征选择最接近的15个种16SRNA序列得出全连锁聚类分析树状谱，亲缘关系相差甚远。根据该菌发酵代谢和特有的芽殖特点，建议建立新科－发酵芽殖菌科（Fermentobadaceaefam.Nov.）。命名：Guhaiyingellagen.nov.guhaiyingiisp.nov.数值分类法的分类原则不同于传统的分类法，其中最重要的区别在于：传统分类法的分类特征有主次之分，而数值分类法则强调所采用的分类特征同等重要，在划分类群时它们都具有同等的地位。数值分类法是根据生物表型特征总的相似性分类，所以其分类结构所表示的是一种表型关系，并不直接表示生物的系统发育，因此数值分类所划分的类群又称为表元(phenon)或表观群(phemoticgroup)以区别于传统的分类单元。但通过对数值分类结构的分析，可以把其分类结果作为建立或修改传统(自然)分类单元(如种、属等)的依据。利用电子计算机鉴定微生物的方法，为数颇众，由最简单的检索法直到复杂的多变量分析技术，如判别分析法、相关系数法、概率最大近似模型法等。简单的检索法，是将传统的鉴定检索表或有关资料，存储于计算机的存储器内，进行微生物鉴定时，将未知菌的试验数据输入计算机，计算机自动进行检索，然后输出结果。这种方法虽然简单易行，但远不能满足现代微生物鉴定的要求，因而多变量分析技术，尤其是概率最大近似模型法，最常用于计算机进行运算鉴定微生物，例如：大多数微量多项试验鉴定系统、快速自动化微生物检测仪器，它们携带的计算机软件进行的自动分析鉴定，就是用概率最大近似模型法进行。计算机用于微生物鉴定严格说目前应是辅助鉴定，因为它不能代替人进行微生物特征的试验，而取得原始数据资料，然而，它存贮、分析、处理极为错综复杂的庞大数据的能力和自动输出鉴定结果的功能，大大提高了微生物鉴定工作的效率，奠定了微生物鉴定的快速、准确、自动化的基础。