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EMS化学诱变大豆叶片早衰突变体转录组学研究
目录
EMS化学诱变大豆叶片早衰突变体转录组学研究（1）．．．．．．．．．．．．．4
一、内容简述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
研究背景及意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
1.1大豆叶片早衰研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
1.2EMS化学诱变技术概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
1.3转录组学在研究突变体中的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
研究目的与任务．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
2.1明确EMS化学诱变大豆叶片早衰突变体的转录组变化．．．．．．．．．．9
2.2探究叶片早衰的分子机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10
2.3为大豆遗传改良提供理论依据．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
二、材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13
实验材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
1.1EMS化学诱变大豆突变体．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
1.2野生型大豆对照．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
实验方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
2.1叶片采集与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
2.2转录组测序及数据分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19
2.3实时荧光定量PCR验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20
三、结果与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21
测序数据概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
1.1测序数据质量及数量统计．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
1.2数据处理流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25
基因突变分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25
2.1突变位点类型及分布．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26
2.2关键基因突变情况分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26
差异表达基因分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28
3.1差异表达基因筛选标准．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30
3.2差异表达基因数量及聚类分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
3.3差异表达基因功能注释及分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
四、讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
EMS化学诱变大豆叶片早衰突变体转录组变化特点．．．．．．．．．．．．33
叶片早衰相关基因的功能及调控网络分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35
本研究与其他研究结果的对比与讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
五、结论与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38
EMS化学诱变大豆叶片早衰突变体转录组学研究（2）．．．．．．．．．．．．39
内容描述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39
1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40
1.2研究目的．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40
1.3研究方法概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．
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