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辣椒CaTUA基因克隆与生物信息学分析
目录
辣椒CaTUA基因克隆与生物信息学分析（1）．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
基础研究概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
1.1.1辣椒产业发展现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
1.1.2CaTUA基因在辣椒中的作用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
1.2研究目的．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
1.2.1明确CaTUA基因的功能．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
1.2.2探究基因调控机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10
材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
2.1辣椒基因资源．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
2.1.1辣椒品种选择．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14
2.1.2基因组DNA提取．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14
2.2基因克隆与测序．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
2.2.1CaTUA基因的PCR扩增．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
2.2.2克隆载体构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
2.2.3基因克隆验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
2.2.4序列测定与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19
2.3生物信息学分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21
2.3.1序列同源性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
2.3.2结构域预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23
2.3.3功能域分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25
2.3.4基因表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27
结果与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27
3.1CaTUA基因序列分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28
3.1.1基因结构特征．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29
3.1.2序列保守性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
3.2基因表达模式．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
3.2.1CaTUA基因在不同辣椒组织中的表达．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34
3.2.2CaTUA基因在不同发育阶段的表达．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35
3.3功能验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36
3.3.1CaTUA基因对辣椒生长的影响．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
3.3.2CaTUA基因对辣椒抗逆性的影响．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38
讨论与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40
4.1CaTUA基因的功能探讨．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42
4.1.1基因调控途径．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43
4.1.2基因在辣椒育种中的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44
4.2研究局限与未来方向．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．
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