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番茄CBF基因家族全基因组测序与分析研究
目录
番茄CBF基因家族全基因组测序与分析研究（1）．．．．．．．．．．．．．．．．．4
内容描述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
番茄CBF基因家族概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
2.1定义和分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
2.2基因结构和功能．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
全基因组测序方法介绍．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
3.1测序技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
3.2数据质量控制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10
CBF基因家族在植物生长发育过程中的作用．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
4.1发育调控．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13
4.2抗逆性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14
4.3生长调节．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
番茄CBF基因家族的系统进化分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
5.1变异模式．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
5.2路径演化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
5.3遗传多样性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19
番茄CBF基因家族的功能注释．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21
6.1RNA-Seq数据处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
6.2启动子区域分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
6.3基因表达模式．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25
CBF基因家族成员间的相互作用网络构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27
7.1物质转运机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27
7.2细胞信号传导．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28
7.3分泌途径．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30
番茄CBF基因家族在作物改良中的应用前景．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
8.1植物耐旱性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
8.2农业产量提升．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33
8.3环境适应能力增强．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35
结论与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
9.1主要发现．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
9.2存在问题．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39
9.3未来研究方向．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40
番茄CBF基因家族全基因组测序与分析研究（2）．．．．．．．．．．．．．．．．42
一、内容概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42
1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43
1.2研究意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45
1.3研究内容与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46
二、材料与方法．．．．．．．．．．．
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