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核桃无融合生殖成熟胚形成过程的转录组与代谢组研究
目录
核桃无融合生殖成熟胚形成过程的转录组与代谢组研究（1）．．．．．．4
一、内容概览．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
（一）研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
（二）研究目的与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
（三）研究方法与技术路线．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
二、材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
（一）实验材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10
（二）实验设计与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
（三）数据收集与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
三、转录组分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13
（一）RNA提取与质量检测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14
（二）转录组测序与数据分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
（三）关键基因表达与调控网络构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
四、代谢组分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
（一）代谢物提取与鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
（二）代谢组学数据分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20
（三）关键代谢途径与调控网络构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20
五、转录组与代谢组联合分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21
（一）共表达基因与代谢物筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23
（二）转录因子与代谢物相互作用网络．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
（三）基因调控网络与代谢物代谢途径关联分析．．．．．．．．．．．．．．．．25
六、结果与讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26
（一）转录组结果分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27
（二）代谢组结果分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29
（三）转录组与代谢组关联分析结果讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30
七、结论与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
（一）主要研究结论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
（二）研究的局限性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33
（三）未来研究方向与应用前景展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35
核桃无融合生殖成熟胚形成过程的转录组与代谢组研究（2）．．．．．36
研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36
1.1核桃产业发展现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
1.2无融合生殖与核桃种子品质．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38
1.3转录组与代谢组技术在种子发育研究中的应用．．．．．．．．．．．．．．39
研究材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41
2.1核桃无融合生殖材料的选择与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41
2.2转录组测序及数据分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43
2.2.1RNA提取与纯化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43
2.2.2建库与测序．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44
2.2.3数据分析与注释．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46
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