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ICS07.100
DB22
C04
吉林省地方标准
DB22/T2567—2016
肺炎链球菌核酸检测PCR法
PolymerasechainreactionmethodforthedetectionofStreptococcuspneumoniae
吉林省质量技术监督局发布
DB22/T2567—2016
前
言
本标准根据GB/T1.1-2009和GB/T20001.4-2015给出的规则起草。
本标准由吉林省卫生和计划生育委员会提出并归口。
本标准起草单位:吉林省疾病预防控制中心。
本标准主要起草人:王慧、杨修军、张炜煜、刘桂华、赵薇、黄鑫、李可维。
I
DB22/T2567—2016
肺炎链球菌核酸检测PCR法
警示——使用本标准的人员应有正规实验室工作的实践经验,本标准并未指出所有可能的安全问
题。使用者有责任采取适当的安全和健康措施,并保证符合国家有关法规规定的条件。
1范围
本标准规定了肺炎链球菌核酸检测PCR法。
本标准适用于肺炎链球菌核酸的实验室检测。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其必威体育精装版版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB19489-2008实验室生物安全通用要求
GB/T6682-2008
分析实验室用水规格和试验方法
WS/T230-2002临床诊断中聚合酶链式反应(PCR)技术的应用
3缩略语
4.310×PCR缓冲液:200mmol/LTris-HCl(pH8.4),200mmol/L氯化钾,20mmol/L氯化镁
4.44dNTP(10mmol/L):dATP、dCTP、dGTP、dTTP
1
DB22/T2567—2016
4.5TaqDNA聚合酶
4.6
分子量标记:100bp~2000bpDNA条带(DNALadder)
4.710×TAE电泳缓冲液(储备液):称取484gTris,量取114.2mL冰醋酸,200mL0.5mol/LEDTA,
溶于水中,定容至2L。分装后高压灭菌备用。使用前稀释成1×TAE电泳缓冲液(工作液)。
4.8
琼脂糖:电泳纯
4.9
溴化乙锭
4.10
4.11
质控菌株:肺炎链球菌ATCC49619
阳性对照:肺炎链球菌ATCC49619菌体DNA
4.12肺炎链球菌种特异性引物
CpsA-F:5’-GGTGTTCTCTATCCTTGTCAGCTCTGTGTCGCTC-3’
CpsA-R:5’-GTGTGAATGGTCGAATCAACTCTAAATGCC-3’
5仪器和设备
5.1PCR仪
5.2生物安全柜
5.3涡旋混合器
5.4金属浴(或水浴锅)
5.5高压灭菌器
5.6微量移液器:10μL、100μL、200μL、1000μL
5.7静脉采血管
6检验程序
6.1.1培养物
用接种环挑取培养基上疑似菌落,置于200μL无菌双蒸水中,振荡混匀形成悬浮菌液。
6.1.3脑脊液
应由经验丰富的专业人员在无菌条件下操作。采集的脑脊液(要求1mL)置于无菌、螺帽管中,并
标记。
6.1.4咽拭子
将咽拭子绕过悬雍垂擦拭后壁,并置于底部滴加3滴~5滴无菌生理盐水的试管中,待检。
2
DB22/T2567—2016
6.2
细菌DNA的提取
对于上述标本,各取0.1mL加到一个0.2mL无菌双蒸水中,振荡混匀,100℃煮沸10min,13000
rpm/min离心10min,吸取上清液即为DNA模版;使用细菌基因组DNA提取试剂盒并按其说明提取制备模
板DNA。同时设阳性对照、阴性对照、空白对照,试剂对照。如不能及时检测,提取的DNA可置于-20℃
保存。
6.3PCR扩增
6.3.1引物
表1引物序列
菌名称
引物序列
DNA片段(bp)
657
肺炎链球菌种特异性CpsA-F:5’-GGTGTTCTCTATCCTTGTCAGCTCTGTGTCGCTC-3’
CpsA-R:5’-GTGTGAATGGTCGAATCAACTCTAAATGCC-3’
6.3.2
PCR反应体系
25μL反应体系包括10×PCR缓冲液2.5μL,dNTP2μL,1UTaq酶,10pmol/L引物上下游各1μL,
模板DNA1μL,双蒸水补足25μL。
6.3.3PCR扩增条件
94℃预变性5min;94℃变性1min,55℃退火1
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