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研究生科研实验教学基地建设
基本实验技能培训
首都医科大学附属北京朝阳医院基础医学研究中心·梁燕
主要内容1.DNA的提取DNA提取原理DNA提取方法操作注意事项2.PCRPCR体系和循环条件PCR操作步骤操作注意事项3.琼脂糖凝胶电泳凝胶电泳原理电泳方法步骤操作注意事项
1.DNA的提取DNA提取原理DNA提取方法操作注意事项
1.1基因组DNA提取原理既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离,又要保持DNA分子的完整。
台式离心机、恒温水浴锅、紫外分光光度计、移液器、离心管(灭菌)、吸头(灭菌)、镊子(灭菌)、离心管架仪器准备:01试剂盒、无水乙醇等试剂准备:021.2基因组DNA提取
试剂盒
试剂盒内容
向52ml的缓冲液GD中加入68ml无水乙醇,并标记;向50ml的缓冲液PW中加入200ml无水乙醇,并标记;加入200ul缓冲液GB,充分颠倒混匀,56℃放置10分钟,期间颠倒混匀数次,溶液应变清亮。将吸附柱CB3放入收集管中准备好,将上述溶液移到吸附柱CB3中,12000rpm离心30秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管;如果步骤5的溶液不能一次加完,可以再次重复步骤6;取200ul全血,加入20ul的蛋白酶K溶液,混匀;加入200ul无水乙醇,充分颠倒混匀,此时可能会出现絮状沉淀。向吸附柱中加500ul的缓冲液GD,12000rpm离心30秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管;123456操作步骤(重点)
操作步骤(重点)7.向吸附柱中加入700ul漂洗液PW,12000rpm离心30秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管;向吸附柱中加入500ul漂洗液PW,12000rpm离心30秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管;将吸附柱和收集管再次离心,12000rpm离心2分钟,将吸附柱至于室温放置数分钟;将吸附柱转入一个干净的离心管中,向吸附膜中间位置悬空滴加50-200ul洗脱缓冲液TB,室温放置2-5分钟,12000rpm离心2分钟,将溶液收集到离心管中;测OD值,计算DNA浓度和纯度;或电泳估计DNA浓度。
01DNA浓度(ug/ul)=OD260×50×稀释倍数/100002OD260=0.103稀释倍数=25004DNA浓度=0.1×50×250/1000=1.25ug/ul计算公式:
使用台式离心机,室温离心01避免样品反复冻融56℃水浴摇匀可消除GB中的沉淀02操作注意事项
2.PCRPCR体系和循环条件PCR操作步骤操作注意事项
试剂准备:ddH2O,PCRBuffer,dNTP,引物,PCR聚合酶,DNA模板仪器准备:PCR仪,微型离心机、移液器、离心管(灭菌)、吸头(灭菌)、镊子(灭菌)、离心管架
2.1PCR体系和循环条件(重点)BclIPCRTotalvolume25ul*2ddH2O16.5ul33ul10×Buffer2.5ul5uldNTP(25mM)2ul4ulPrimerF(10mM)1ul2ulPrimerR(10mM)1ul2ulExTaq(1U/ul)1ul2ulSum24ul48ul48/2=24ulTemplateDNA(0.1ug/ul)1ul1ul
95℃,30s(预变性)60℃,30s72℃,30s95℃,30s72℃,30s(后延伸)30cycles
PCR操作步骤(重点)计算好所需扩增的PCR体系;打开PCR仪预热,设置PCR循环条件;准备试剂,融化,离心,置于冰上,备用;按顺序加样,混匀,离心,分装;加入模板DNA,混匀,离心;放入PCR仪,Start。0102
01避免试剂反复冻融02计算总量,顺序加样03更换吸头,避免污染2.3PCR操作注意事项
凝胶电泳原理01电泳方法步骤02操作注意事项033.琼脂糖凝胶电泳
3.1琼脂糖凝胶电泳原理DNA分子带负电荷,在直流电场中由负极移向正极;其移动速度与线性DNA片段长度成反比。
1配置1%的胶:称1g琼脂糖于适当大小三角瓶中,倒入100ml的1*TAE,微波炉加热至完全融化;2待凝胶温度降至50-60度时,加入1ul的EB(10mg/ml),摇匀,将胶倒入放好梳子的电泳板中,自然冷却30-60分钟;3轻轻拔掉梳子,将胶放入电泳槽中,倒入1*TAE,没过加样孔;4按照1ul上样Buffer+5ul的DNA混合后,点样;每排留一个孔加DNAmarker;5100V电泳30分钟,凝胶成像仪照相。3.2琼脂糖凝胶电泳方法(重点)
电泳操作注意事项带手套操作EB凝胶完全融化凝胶冷却时间至少30分钟
MII-3II-2II-1I-2I-10应用BclI/RFLP多
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