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ICS11.220
DB22
B41
吉林省地方标准
DB22/T3091—2019
鹿结核病病原菌实时荧光PCR检测方法
Real-timePCRmethodforthedetectionofTuberculosispathogenicorganismindeer
吉林省市场监督管理厅
发布
DB22/T3091—2019
前
言
本标准按照GB/T1.1-2009和GB/T20001.4-2015给出的规则起草。
本标准由吉林省畜牧业管理局提出并归口。
本标准起草单位:吉林农业大学,中国农业科学院特产研究所。
本标准主要起草人:曾范利、李健明、时坤、宗颖、冷雪、赵丹、杜锐、徐超。
I
DB22/T3091—2019
鹿结核病病原菌实时荧光PCR检测方法
1范围
本标准规定了鹿结核病病原菌实时荧光PCR检测方法的试剂仪器、操作程序、结果判定。
本标准适用于梅花鹿、马鹿组织器官、血液中的结核分枝杆菌、牛分枝杆菌的检测。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其必威体育精装版版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T6682
分析实验室用水规格和试验方法
GB19489实验室生物安全通用要求
GB/T27401实验室质量控制规范动物检疫
3
术语与定义
一种在DNA扩增反应中,以荧光化学物质检测每次聚合酶链式反应(PCR)循环后产物总量的方法。
下列缩略语适用于本文件。
以DNA为模板进行PCR扩增,通过该反应,利用荧光标记的特异性的探针,对PCR产物进行标记
跟踪,实时在线监控反应过程,结合相应的软件对产物进行分析,是否获得目的基因,并最终计算待测
样品模板的初始浓度。
1
DB22/T3091—2019
6.1试剂
除另有说明,本方法仅使用分析纯试剂和重蒸馏水或符合GB/T6682规定的一级水。
6.1.1实时荧光PCR扩增所用的引物序列见表1。
表1引物序列
类别
核酸序列(5’-3’)
上游引物5’-AGACCCCGGGACCTTCACTACAAC-3’
下游引物5’-AACGACTCCGCCCCAACTG-3’
探针5’-FAM-ACGGTTTGTGTAGGATAGGTGGGA-TAMRA-3’
上游引物5’-CGGGCGTTTTGTCGCATCC-3’
下游引物5’-GGGCGTGGGCAGACTTCGT-3’
结核分枝杆菌
牛分枝杆菌
探针5’-FAM-CTTGCGGAGGAGGTTGGGGACA–TAMRA-3’
6.1.2动物血液与组织DNA提取试剂盒。
6.1.3Taq酶。
6.1.4磷酸盐缓冲液(PBS)(0.01mol/L,pH7.4)。
6.1.50.5mol/LEDTA(pH8.0)。
6.2材料
6.2.1离心管(50mL、15mL、1.5mL)。
6.2.2吸头(200μL~1000μL、20μL~200μL、2μL~20μL、0.5μL~10μL)。
6.2.3荧光定量PCR管。
7仪器设备
采样、样品处理及检测过程所涉及的实验操作,应按GB19489和GB/T27401的有关规定执行。
9操作步骤
9.1样品的采集和保存
采集下颌、咽后、肺门、肠系膜淋巴结,肺,肝,脾等组织样品不少于5g。做好标识,置于密闭
容器内,冷冻或4℃冷藏保存和运输。
2
DB22/T3091—2019
9.1.2血液样品的采集和保存
使用EDTA作为抗凝剂,无菌采集静脉血不少于5mL,样品采集后于2℃~8℃冷藏保存,然后
立即运送实验室(夏季不超过24h,冬季不超过2d)。短时间不能送达的样品应于-20℃冷冻保存。
样品运送时应保持冷冻状态,不应反复冻融。
9.2DNA提取
按照商品化试剂盒说明书要求提取相应样品的DNA。
9.3对照样品
9.3.1阳性对照
取结核分枝杆菌标准菌株灭活菌,牛结核分枝杆菌灭活菌作为阳性对照。
9.3.2阴性对照
取标准阴性样品作为阴性对照。
9.3.3空白对照
去离子水。
9.4扩增反应体系
结核分枝杆菌实时荧光PCR扩增反应体系见表2。
表2结核分枝杆菌实时荧光PCR反应体系
3
DB22/T3091—2019
牛分枝杆菌实时荧光PCR扩增反应体系见表3。
表3牛分枝杆菌实时荧光PCR反应体系
试剂
剂量
premixExTa
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